RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 MYMKA6NI61 221 aa20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 GDF9O60383 454 aa20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 TOM1L1O75674 476 aa20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 KIF4AO95239 1232 aa20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 PSMC3P17980 439 aa20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 PROZP22891 400 aa20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 ELF1P32519 619 aa20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 GRM5P41594 1212 aa20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.91■□□□□ 0.945e-7■■■■□ 21.2
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SGMS1-208ENST00000608287 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 ZPBP2Q6X784 338 aa20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 HASPINQ8TF76 798 aa20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 RABGGTAQ92696 567 aa20.91■□□□□ 0.94
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SGMS1-208ENST00000608287 MTRRQ9UBK8 725 aa20.91■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.9■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 TRAPPC3O43617 180 aa20.9■□□□□ 0.94
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SGMS1-208ENST00000608287 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 SHC4Q6S5L8 630 aa20.9■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.9■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 E2F7Q96AV8 911 aa20.9■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.9■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 TBX20Q9UMR3 447 aa20.9■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.9■□□□□ 0.94
SGMS1-208ENST00000608287 ABLIM1O14639 778 aa20.89■□□□□ 0.93
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SGMS1-208ENST00000608287 HRO43593 1189 aa20.89■□□□□ 0.93
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SGMS1-208ENST00000608287 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.89■□□□□ 0.93
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SGMS1-208ENST00000608287 ELMOD1Q8N336 334 aa20.89■□□□□ 0.93
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SGMS1-208ENST00000608287 ZNF263O14978 683 aa20.88■□□□□ 0.93
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SGMS1-208ENST00000608287 LEMD2Q8NC56 503 aa20.88■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.88■□□□□ 0.93
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SGMS1-208ENST00000608287 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.87■□□□□ 0.93
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SGMS1-208ENST00000608287 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.87■□□□□ 0.93
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SGMS1-208ENST00000608287 ADAM12O43184 909 aa20.86■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 FCARP24071 287 aa20.86■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 E2F4Q16254 413 aa20.86■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 IQCEQ6IPM2 695 aa20.86■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.86■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 IQUBQ8NA54 791 aa20.86■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 UROC1Q96N76 676 aa20.86■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 GPR88Q9GZN0 384 aa20.86■□□□□ 0.93
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