RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602173.5

RAB4B-208, Transcript of RAB4B, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB4B, Length 592 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB4B-208	ENST00000602173	SPTLC1	O15269	473 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	MYL4	P12829	197 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	GJA1	P17302	382 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	CD72	P21854	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	PAX3	P23760	479 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	DUSP4	Q13115	394 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	SHISA7	A6NL88	538 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	CYP11A1	P05108	521 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	SP9	P0CG40	484 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	ODC1	P11926	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	ADSS	P30520	456 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	KCNA1	Q09470	495 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	DNASE1L2	Q92874	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	TMEM209	Q96SK2	561 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	NELL2	Q99435	816 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173		R4GN57	208 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173		A0A087X0B3	334 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	GAP43	P17677	238 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	PLD1	Q13393	1074 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	FZD5	Q13467	585 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	GRM2	Q14416	872 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	POSTN	Q15063	836 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	TEAD2	Q15562	447 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	ADSSL1	Q8N142	457 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	CLDN23	Q96B33	292 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB4B-208	ENST00000602173	PSMC3	P17980	439 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	TXLNA	P40222	546 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	VIPR2	P41587	438 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	ALDH1A3	P47895	512 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	EPHB3	P54753	998 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	BECN1	Q14457	450 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB4B-208	ENST00000602173	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25

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