RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRCC3	P46736	316 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC11A1	P49279	550 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM270	Q6UE05	265 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	PANX2	Q96RD6	677 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACP6	Q9NPH0	428 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	GALT	P07902	379 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	9.8	□□□□□ -0.84	5e-7	■■□□□ 12
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCAR1	P56945	870 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	RASIP1	Q5U651	963 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	SENP8	Q96LD8	212 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC9A7	Q96T83	725 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	CWH43	Q9H720	699 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	L1RE1	Q9UN81	338 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576		H0YGN5	161 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYB561D2	O14569	222 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP26A1	O43174	497 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	HUS1	O60921	280 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	SKIL	P12757	684 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF394	Q53GI3	561 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBR7	Q8N806	425 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	APPL2	Q8NEU8	664 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	SHH	Q15465	462 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHP1	Q99653	195 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	INSL6	Q9Y581	213 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	TADA2A	O75478	443 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	CALCA	P01258	141 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLCN1	P35523	988 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASIC2	Q16515	512 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	MEA1	Q16626	185 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	WSCD1	Q658N2	575 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	MARCH5	Q9NX47	278 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		9.79	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	TLL1	O43897	1013 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	CILP	O75339	1184 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	INCA1	Q0VD86	236 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	ORC1	Q13415	861 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM139	Q8IV31	216 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	TWNK	Q96RR1	684 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAD9A	Q99638	391 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	NME7	Q9Y5B8	376 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	HCRT	O43612	131 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	FER	P16591	822 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDST1	P52848	882 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	DPH6	Q7L8W6	267 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	WHAMM	Q8TF30	809 aa		9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUSD3	Q96L08	255 aa		9.78	□□□□□ -0.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms