RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 E2F7Q96AV8 911 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM209Q96SK2 561 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC38A8A6NNN8 435 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SDHBP21912 280 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHB3P54753 998 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 FCHO2Q0JRZ9 810 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 RILPL1Q5EBL4 403 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR44Q5JSH3 913 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPPQ6IPU0 288 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 YAF2Q8IY57 180 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD17Q8N5Z5 321 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ATAD1Q8NBU5 361 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 MKNK1Q9BUB5 465 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 MTMR11A4FU01 709 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CHADO15335 359 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SOAT2O75908 522 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCL12P48061 93 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 LIG4P49917 911 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP8P85298 464 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 DMWDQ09019 674 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 OVOS1Q6IE37 1185 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNN1Q92952 543 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC3BQ96PB8 259 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 NCOR2Q9Y618 2525 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 H0YCG3 227 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TYMPP19971 482 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH1A3P47895 512 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SPEM2Q0P670 501 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 MYBPC2Q14324 1141 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 GAREM2Q75VX8 874 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC15Q8TF66 581 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 MSANTD3Q96H12 275 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 REEP2Q9BRK0 252 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB23Q9ULC3 237 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TBX20Q9UMR3 447 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 F5P12259 2224 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 OGTO15294 1046 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 XPOTO43592 962 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ADRB2P07550 413 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA1Q5VX52 437 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 LAIR1Q6GTX8 287 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNDC11Q6PKC3 985 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR23BQ6ZRT6 265 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZS52 159 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ODF2LQ9ULJ1 636 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGRP01833 764 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 LILRA4P59901 499 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 KYAT1Q16773 422 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 JADE1Q6IE81 842 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SPEM1Q8N4L4 309 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10T2Q8NGX3 314 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC8Q8TAM2 541 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMG2Q969U7 264 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFYVE19Q96K21 471 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SENP8Q96LD8 212 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ATXN3LQ9H3M9 355 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 DCDC2BA2VCK2 349 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 K7ENM7 598 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 NFICP08651 508 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ODC1P11926 461 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 CTHP32929 405 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 FNTBP49356 437 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC32Q14392 662 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC39A4Q6P5W5 647 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM212AQ96EL1 285 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 RTKNQ9BST9 563 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 GTSE1Q9NYZ3 720 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB3Q9Y575 518 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0B4J269 797 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 MYBPHLA2RUH7 354 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 K7ESF4 209 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 HRO43593 1189 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRR2P28476 465 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 CDR1P51861 262 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR158Q5T848 1215 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf57Q5W0N0 161 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf228Q6PIY5 440 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 GPBP1Q86WP2 473 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms