RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 CORO1BQ9BR76 489 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CUEDC2Q9H467 287 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 DPP3Q9NY33 737 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHA7Q9UN72 937 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 INSL5Q9Y5Q6 135 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TSC2P49815 1807 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CLSTN1O94985 981 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 IL18RAPO95256 599 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SEC24AO95486 1093 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 C1RP00736 705 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 LAMP2P13473 410 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ADSSP30520 456 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ZBTB6Q15916 424 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 UVSSAQ2YD98 709 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 OVOS1Q6IE37 1185 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 NELFCDQ8IXH7 590 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SIX5Q8N196 739 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM84AQ96KN4 292 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SENP8Q96LD8 212 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA32Q96LK8 384 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 KXD1Q9BQD3 176 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM9Q9C026 710 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ASB7Q9H672 318 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM206Q9H813 350 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 EPS15L1Q9UBC2 864 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CA14Q9ULX7 337 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 DERAQ9Y315 318 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 NUMBLQ9Y6R0 609 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIOO75962 3097 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 M0QZQ0 153 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SPTLC1O15269 473 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 MAP3K7O43318 606 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 RHOP08100 348 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT19P08727 400 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 MYL4P12829 197 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ATF2P15336 505 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CEBPBP17676 345 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TAF6P49848 677 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 WNT7BP56706 349 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 LILRA4P59901 499 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT85P78386 507 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TWF1Q12792 350 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 BFSP1Q12934 665 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 RESP18Q5W5W9 173 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 METTL23Q86XA0 190 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 BRSK2Q8IWQ3 736 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FGF13Q92913 245 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF560Q96MR9 790 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 STRA6Q9BX79 667 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CDH7Q9ULB5 785 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 C2CD2Q9Y426 696 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SCN1AP35498 2009 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 OR6C75A6NL08 312 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CYB561D2O14569 222 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 EXTL3O43909 919 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ABLIM3O94929 683 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ITGB3P05106 788 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 GARTP22102 1010 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP2J2P51589 502 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 HTR4Q13639 388 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC5A9Q2M3M2 681 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SV2CQ496J9 727 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 TPGS2Q68CL5 300 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ATL3Q6DD88 541 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 IQCEQ6IPM2 695 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PARM1Q6UWI2 310 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 GPD1LQ8N335 351 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms