RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 ADCY1Q08828 1119 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 DPYDQ12882 1025 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 EDAQ92838 391 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 FNBP1Q96RU3 617 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 INTS13Q9NVM9 706 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 MYO10Q9HD67 2058 aa22.71■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 RHOBTB3O94955 611 aa22.71■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 CYP11A1P05108 521 aa22.71■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 POU2F2P09086 479 aa22.71■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 FSHRP23945 695 aa22.71■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 ZXDAP98168 799 aa22.71■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 BFSP1Q12934 665 aa22.71■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 MYBPC2Q14324 1141 aa22.71■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.71■■□□□ 1.23
SNAP23-216ENST00000568331 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 TNNI1P19237 187 aa22.7■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 CYP24A1Q07973 514 aa22.7■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.7■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 WDR49Q8IV35 697 aa22.7■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 ELMOD1Q8N336 334 aa22.7■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.7■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 PDXKO00764 312 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 HUS1O60921 280 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 SEC24AO95486 1093 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 OR4Q2P0C623 313 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 MYO1EQ12965 1108 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 GPR17Q13304 367 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 MTMR3Q13615 1198 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 KCNB1Q14721 858 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 PSMD6Q15008 389 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.69■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 ASGR2P07307 311 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 PTPN2P17706 415 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 NTHL1P78549 312 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 WSCD1Q658N2 575 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 BORCS6Q96GS4 357 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 FAM84AQ96KN4 292 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 MYADMQ96S97 322 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 CGRRF1Q99675 332 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 RMND1Q9NWS8 449 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 PTPRJQ12913 1337 aa22.67■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 PRR33A8MZF0 331 aa22.67■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.67■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.67■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.67■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.67■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.67■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 SIX4Q9UIU6 781 aa22.67■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 SMC2O95347 1197 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 NR3C1P04150 777 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 TWF1Q12792 350 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 PLD1Q13393 1074 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 PNOCQ13519 176 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 IQCEQ6IPM2 695 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 HPDLQ96IR7 371 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.66■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 LAMP2P13473 410 aa22.65■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.65■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 DUSP4Q13115 394 aa22.65■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.65■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms