RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SI	P14410	1827 aa		19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP73	A6NFT4	308 aa		19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559		O00370	1275 aa		19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TAP1	Q03518	808 aa		19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC14	Q15048	493 aa		19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ZPBP2	Q6X784	338 aa		19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	19.5	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	LIAS	O43766	372 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEA4	P43358	317 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	P3H1	Q32P28	736 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	MICALL2	Q8IY33	904 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	PTPN7	P35236	360 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	SP2	Q02086	613 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CHADL	Q6NUI6	762 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	WDR49	Q8IV35	697 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	19.49	■□□□□ 0.71	1e-11	■■■■□ 22.9
RRN3-205	ENST00000563559	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	19.49	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ADCY3	O60266	1144 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	MGRN1	O60291	552 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	STX2	P32856	288 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	GJC1	P36383	396 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	EFNA5	P52803	228 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TGFB2	P61812	414 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	UBR7	Q8N806	425 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CHST13	Q8NET6	341 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEB18	Q96M61	343 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CREB1	P16220	341 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC63	Q8NA47	563 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	PPCS	Q9HAB8	311 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	PPME1	Q9Y570	386 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		19.48	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	KRT1	P04264	644 aa		19.47	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	SLC8A1	P32418	973 aa		19.47	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	SURF1	Q15526	300 aa		19.47	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		19.47	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		19.47	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf72	Q96LT7	481 aa		19.47	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	MORF4L2	Q15014	288 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA21	Q7Z572	469 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TDRP	Q86YL5	185 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ALLC	Q8N6M5	410 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	PWWP2A	Q96N64	755 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	YY1AP1	Q9H869	796 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	EURL	Q9NYK6	297 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CEP83	Q9Y592	693 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	IL9R	Q01113	521 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CYP4X1	Q8N118	509 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TBK1	Q9UHD2	729 aa		19.46	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		19.46	■□□□□ 0.71

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