RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 RFC4P35249 363 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 MAGEA9P43362 315 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 SOX9P48436 509 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 GPC3P51654 580 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 RPP38P78345 283 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 PHEXP78562 749 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC57Q2TAC2 916 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 LETM2Q2VYF4 491 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ODF2Q5BJF6 829 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CNNM4Q6P4Q7 775 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ATCAYQ86WG3 371 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 KRT73Q86Y46 540 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 UNC45BQ8IWX7 931 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ANKRD35Q8N283 1001 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 LILRB4Q8NHJ6 448 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 MOSPD2Q8NHP6 518 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CEP70Q8NHQ1 597 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 FBXO27Q8NI29 283 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 DEPTORQ8TB45 409 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ZFAND2BQ8WV99 257 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 LPIN2Q92539 896 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 NXPE3Q969Y0 559 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TUBGCP3Q96CW5 907 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TMX3Q96JJ7 454 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ART5Q96L15 291 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ZDHHC15Q96MV8 337 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CMTM3Q96MX0 182 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 FAM129BQ96TA1 746 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 SPON2Q9BUD6 331 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 PHF20Q9BVI0 1012 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ACAT2Q9BWD1 397 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ACPTQ9BZG2 426 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM4Q9C037 500 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 UBN1Q9NPG3 1134 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 SDHAF3Q9NRP4 125 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 PCMTD2Q9NV79 361 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 VPS18Q9P253 973 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 FETUBQ9UGM5 382 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 FAM153AQ9UHL3 310 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM5Q9Y2B1 443 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 FLT1P17948 1338 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 PXDNLA1KZ92 1463 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 NALCNQ8IZF0 1738 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 LRRIQ4A6NIV6 560 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 K7EPI3 171 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 HDAC3O15379 428 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 GPR39O43194 453 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 STRNO43815 780 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 OR5F1O95221 314 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 PLGP00747 810 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 HEXBP07686 556 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 POLR2MP0CAP2 368 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 FGFR4P22455 802 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 KELP23276 732 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CD68P34810 354 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 MAPKAPK2P49137 400 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGDIBP52566 201 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 DRG2P55039 364 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CYP4F8P98187 520 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CETN1Q12798 172 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TRPC3Q13507 836 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 MAPRE2Q15555 327 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CFAP100Q494V2 611 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 FBXO48Q5FWF7 155 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CEP78Q5JTW2 689 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TCTE1Q5JU00 501 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 SYDE2Q5VT97 1194 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM154Q6P9G4 183 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ACAD11Q709F0 780 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TMC6Q7Z403 805 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 KIAA1328Q86T90 577 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 HID1Q8IV36 788 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 OR8H3Q8N146 312 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms