RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558550.1

EFTUD1P1-202, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD1P1, Length 418 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TSC2P49815 1807 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HIDE1A8MVS5 230 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FSCN2O14926 492 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 P4HA2O15460 535 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EFEMP2O95967 443 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ASS1P00966 412 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FOSL2P15408 326 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TYMPP19971 482 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KLRC2P26717 231 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NRIP1P48552 1158 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARPP19P56211 112 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF445P59923 1031 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CREMQ03060 361 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NCAPHQ15003 741 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IQCB1Q15051 598 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KRT31Q15323 416 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PTPN14Q15678 1187 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CBWD6Q4V339 395 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 VWA3BQ502W6 1294 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RTP2Q5QGT7 225 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WSCD1Q658N2 575 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GBP6Q6ZN66 633 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DPH6Q7L8W6 267 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 THEM5Q8N1Q8 247 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SEMA4DQ92854 862 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GUCD1Q96NT3 240 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 VPS16Q9H269 839 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SNX25Q9H3E2 840 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NDST4Q9H3R1 872 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGFLR1Q9H665 355 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RAB20Q9NX57 234 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 POLIQ9UNA4 740 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MYH10P35580 1976 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PLXNA3P51805 1871 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PER2O15055 1255 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PMM2O15305 246 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 OAZ2O95190 189 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CYP11A1P05108 521 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADH1AP07327 375 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CNPP09543 421 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATP1A3P13637 1013 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 OR1D2P34982 312 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NDUFV1P49821 464 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LRMPQ12912 555 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF280DQ6N043 979 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PALB2Q86YC2 1186 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GPR65Q8IYL9 337 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADGRF2Q8IZF7 708 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMEM86AQ8N2M4 240 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PPM1EQ8WY54 764 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NT5C1BQ96P26 610 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KLHL5Q96PQ7 755 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD1P1-202ENST00000558550 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms