RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554184.5

CCNB1IP1-210, Transcript of cyclin B1 interacting protein 1, human

TSL 3

Gene CCNB1IP1, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRIM14	Q14142	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GGT6	Q6P531	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BDH2	Q9BUT1	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	APOL1	O14791	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MFAP3L	O75121	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	VPS4B	O75351	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KIF20A	O95235	890 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PPM1A	P35813	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PLP2	Q04941	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DOK3	Q7L591	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		M0QYG6	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LEFTY2	O00292	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NBN	O60934	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TCEA3	O75764	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FGF18	O76093	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GNAI2	P04899	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GRP	P07492	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ALAS1	P13196	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC11A2	P49281	568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAPK10	P53779	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		Q8TCH9	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NEU1	Q99519	415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF623	O75123	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MT-ND5	P03915	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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