RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 INPPL1O15357 1258 aa21.57■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 SLC11A1P49279 550 aa21.57■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.57■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 ANO5Q75V66 913 aa21.57■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM206Q9H813 350 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 DMAC2Q9NW81 257 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.57■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 SKIP12755 728 aa21.56■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 XKR3Q5GH77 459 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.56■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC175P0C221 793 aa21.55■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 NCKAP1LP55160 1127 aa21.55■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNN1Q92952 543 aa21.55■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 TBC1D4O60343 1298 aa21.54■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 ACCSQ96QU6 501 aa21.54■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.54■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 K7ENM7 598 aa21.53■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 MAGEA9P43362 315 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNA1Q09470 495 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNMA1Q12791 1236 aa21.53■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 NEK11Q8NG66 645 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 NLRP7Q8WX94 980 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 NELL1Q92832 810 aa21.53■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 FAM167AQ96KS9 214 aa21.53■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 POLD4Q9HCU8 107 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 AKAP3O75969 853 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 GLUD1P00367 558 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 NPEPPSP55786 919 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 ETF1P62495 437 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 PRKCEQ02156 737 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNH2Q12809 1159 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 PPM1JQ5JR12 505 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC170Q8IYT3 715 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 KIF18AQ8NI77 898 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 CEP170P1Q96L14 293 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 PIDD1Q9HB75 910 aa21.52■■□□□ 1.04
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