RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542337.5

DDB1-220, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene DDB1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-220ENST00000542337 GARTP22102 1010 aa21.88■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 KCNA1Q09470 495 aa21.88■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 PRSS36Q5K4E3 855 aa21.88■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 DOCK8Q8NF50 2099 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CYB561D2O14569 222 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 PNPLA4P41247 253 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 PRKCQQ04759 706 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 DUSP4Q13115 394 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ELSPBP1Q96BH3 223 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 DHX58Q96C10 678 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ZNF560Q96MR9 790 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ZFP14Q9HCL3 533 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CEP72Q9P209 647 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 YIPF1Q9Y548 306 aa21.87■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 SPTLC1O15269 473 aa21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CYP11A1P05108 521 aa21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CASP5P51878 434 aa21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 SV2CQ496J9 727 aa21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CENPPQ6IPU0 288 aa21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 TCEAL4Q96EI5 215 aa21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 GPR88Q9GZN0 384 aa21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ASB3Q9Y575 518 aa21.86■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 EXTL3O43909 919 aa21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 STARD6P59095 220 aa21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ATL3Q6DD88 541 aa21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 TANGO2Q6ICL3 276 aa21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 SAAL1Q96ER3 474 aa21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CFAP45Q9UL16 551 aa21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 KPNA7A9QM74 516 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 GFRA3O60609 400 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 FGF19O95750 216 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 F13A1P00488 732 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ME1P48163 572 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 EPHA5P54756 1037 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ASIC1P78348 528 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 SMARCB1Q12824 385 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ANGPT1Q15389 498 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ITIH5Q86UX2 942 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 PCIF1Q9H4Z3 704 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 MTMR11A4FU01 709 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CCR2P41597 374 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 VEPH1Q14D04 833 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 SLC39A12Q504Y0 691 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 SMARCD2Q92925 531 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 ASB16Q96NS5 453 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 TRIM9Q9C026 710 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.83■■□□□ 1.09
DDB1-220ENST00000542337 PROB1E7EW31 1015 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 VNN2O95498 520 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 NBL1P41271 181 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 E2F4Q16254 413 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 TAF12Q16514 161 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 WSCD1Q658N2 575 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 SHC4Q6S5L8 630 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 GPD1LQ8N335 351 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 PJA1Q8NG27 643 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 E2F7Q96AV8 911 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 TMEM209Q96SK2 561 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 NELL2Q99435 816 aa21.82■■□□□ 1.08
DDB1-220ENST00000542337 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms