RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DMAC2Q9NW81 257 aa17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RMND1Q9NWS8 449 aa17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DOCK6Q96HP0 2047 aa17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTPRJQ12913 1337 aa17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C2CD4DB7Z1M9 353 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EXOC3O60645 756 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNNC2P02585 160 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CPB1P15086 417 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NFIL3Q16649 462 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DUOXA2Q1HG44 320 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPATA20Q8TB22 786 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MFSD14AQ96MC6 490 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GSDMAQ96QA5 445 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FNBP1Q96RU3 617 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CGRRF1Q99675 332 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GDAP2Q9NXN4 497 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AGAP1Q9UPQ3 857 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CYB561D2O14569 222 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CALUO43852 315 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ELF1P32519 619 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RBP5P82980 135 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GPR17Q13304 367 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 METTL23Q86XA0 190 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RDH13Q8NBN7 331 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR5B17Q8NGF7 314 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPATA18Q8TC71 538 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MUTYHQ9UIF7 546 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SIX4Q9UIU6 781 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NR3C1P04150 777 aa17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SP100P23497 879 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARPP19P56211 112 aa17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PNOCQ13519 176 aa17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COBLL1Q53SF7 1204 aa17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EPHX3Q9H6B9 360 aa17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSFX1Q9UBD0 423 aa17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 INSL5Q9Y5Q6 135 aa17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTPRDP23468 1912 aa17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRRG1O14668 218 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAPK13O15264 365 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMC2O95347 1197 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRG1P02750 347 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KRT19P08727 400 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DLATP10515 647 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNNI1P19237 187 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AP3M2P53677 418 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLDN10P78369 228 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADCY1Q08828 1119 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYO1EQ12965 1108 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTPN21Q16825 1174 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZCWPW2Q504Y3 356 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM86AQ8N2M4 240 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOP6BLQ8N6T0 577 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CYP4F11Q9HBI6 524 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EPS15L1Q9UBC2 864 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYO10Q9HD67 2058 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCL16O15467 120 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KINO60870 393 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SEC24AO95486 1093 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STAU1O95793 577 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ENPEPQ07075 957 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMARCB1Q12824 385 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BFSP1Q12934 665 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WSCD1Q658N2 575 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DPH6Q7L8W6 267 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 THEM5Q8N1Q8 247 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR10T2Q8NGX3 314 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PARD3BQ8TEW8 1205 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMARCE1Q969G3 411 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC127Q96BQ5 260 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM84AQ96KN4 292 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RTP3Q9BQQ7 232 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DENND4CQ5VZ89 1909 aa17.4■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OBSL1O75147 1896 aa17.39■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MTMR11A4FU01 709 aa17.39■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GPR37L1O60883 481 aa17.39■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HUS1O60921 280 aa17.39■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VNN2O95498 520 aa17.39■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR4Q2P0C623 313 aa17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms