RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RREB1	Q92766	1687 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	FFAR3	O14843	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	MTSS1	O43312	755 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	AMY1A	P04745	511 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KIT	P10721	976 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	MYF5	P13349	255 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SLC7A1	P30825	629 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KCNJ5	P48544	419 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ADCY7	P51828	1080 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CTXN1	P60606	82 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CAP1	Q01518	475 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TLE1	Q04724	770 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	GJA10	Q969M2	543 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ATP7B	P35670	1465 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	GNAI3	P08754	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SLC5A1	P13866	664 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	BRAF	P15056	766 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	FPR1	P21462	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PCSK1	P29120	753 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	GNAI1	P63096	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SP140	Q13342	867 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TBR1	Q16650	682 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CHD4	Q14839	1912 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	EP400	Q96L91	3159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1W2PRX2	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-223	ENST00000536089	KPNA5	O15131	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-223	ENST00000536089	CD1A	P06126	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-223	ENST00000536089	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-223	ENST00000536089	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-223	ENST00000536089	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-223	ENST00000536089	ATP5J	P18859	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-223	ENST00000536089	HOXA5	P20719	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-223	ENST00000536089	SERPINB3	P29508	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-223	ENST00000536089	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-223	ENST00000536089	HTR3A	P46098	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-223	ENST00000536089	GZMK	P49863	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-223	ENST00000536089	RAC3	P60763	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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