RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 RFPL1O75677 317 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 RECQL4O94761 1208 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 SPDEFO95238 335 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CD1AP06126 327 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CKBP12277 381 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 COL10A1Q03692 680 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 NOGQ13253 232 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ODR4Q5SWX8 454 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 AMER2Q8N7J2 671 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 MVB12AQ96EY5 273 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 LRFN3Q9BTN0 628 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 SYBUQ9NX95 663 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 PREX2Q70Z35 1606 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 A2MP01023 1474 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 SYCP2Q9BX26 1530 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TNRQ92752 1358 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 EEA1Q15075 1411 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 UNC119BA6NIH7 251 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CYR61O00622 381 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 KIF3BO15066 747 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 LAG3P18627 525 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 PRDX5P30044 214 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 RESTQ13127 1097 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TP53BP2Q13625 1128 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGEF19Q8IW93 802 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 FITM2Q8N6M3 262 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TMIEQ8NEW7 156 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ASB10Q8WXI3 467 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 SERHL2Q9H4I8 314 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 JKAMPQ9P055 326 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 EID1Q9Y6B2 187 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ATP7AQ04656 1500 aa4.91□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa4.9□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 HAUS5O94927 633 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 AGFG2O95081 481 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MATN4O95460 622 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MAKP20794 623 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PROZP22891 400 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 CXADRP78310 365 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 HSD11B2P80365 405 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 ABHD18Q0P651 414 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 CYP2A13Q16696 494 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PGS1Q32NB8 556 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SLC4A10Q6U841 1118 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF365Q70YC5 407 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R3BQ86XI6 285 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 NUP133Q8WUM0 1156 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 AIFM3Q96NN9 605 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 TAAR9Q96RI9 348 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM74BQ9NUR3 256 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 E2F8A0AVK6 867 aa4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 AP1G1O43747 822 aa4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 ALAS1P13196 640 aa4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MCM7P33993 719 aa4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PTGS2P35354 604 aa4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 GDF5P43026 501 aa4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 GPR149Q86SP6 731 aa4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 C3orf20Q8ND61 904 aa4.89□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms