RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	SEMA4D	Q92854	862 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	KLHL29	Q96CT2	875 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	BTBD6	Q96KE9	485 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ACCS	Q96QU6	501 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	IDI2	Q9BXS1	227 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	TLE6	Q9H808	572 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC42	Q9Y546	428 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	NFASC	O94856	1347 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746		E7ENQ6	273 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	CLGN	O14967	610 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP26A1	O43174	497 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	SPOP	O43791	374 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	MAN1A2	O60476	641 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	DIAPH2	O60879	1101 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	PEX11A	O75192	247 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP5H	O75947	161 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	UNC5C	O95185	931 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ASMTL	O95671	621 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	T-ENOL	P0DO92	83 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	BMP3	P12645	472 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	GYS1	P13807	737 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	BRAF	P15056	766 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ATF2	P15336	505 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP11B1	P15538	503 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	GM2A	P17900	193 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	IGFBP4	P22692	258 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	KLRC2	P26717	231 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP5D	P30049	168 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF76	P36508	570 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	MXI1	P50539	228 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	GPC3	P51654	580 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ITGA8	P53708	1063 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	GTF2B	Q00403	316 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	SATB1	Q01826	763 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ENPEP	Q07075	957 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	POU4F2	Q12837	409 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	STRN3	Q13033	797 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	STAT4	Q14765	748 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	TNIP1	Q15025	636 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	RASA2	Q15283	850 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	OCLN	Q16625	522 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	KYNU	Q16719	465 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP55	Q53EZ4	464 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	SGO2	Q562F6	1265 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	TRABD2A	Q86V40	505 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC25	Q86WR0	208 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	TEKT1	Q969V4	418 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF653	Q96CK0	615 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
ATXN3-212	ENST00000515746	RIT2	Q99578	217 aa		5.28	□□□□□ -1.56

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