RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
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RRN3P1-201ENST00000514813 SAMD11Q96NU1 681 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 CEP89Q96ST8 783 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 CREB3O43889 395 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 NR3C1P04150 777 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 PIK3CAP42336 1068 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 THEM5Q8N1Q8 247 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC01465Q8N7H1 131 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 CNPP09543 421 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 PLCB3Q01970 1234 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 PPM1LQ5SGD2 360 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 ELMOD1Q8N336 334 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC22A17Q8WUG5 538 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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RRN3P1-201ENST00000514813 PI4K2AQ9BTU6 479 aa7.03□□□□□ -1.28
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RRN3P1-201ENST00000514813 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM50BQ9Y247 325 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 B4GALT3O60512 393 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 SOAT2O75908 522 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 DNAJB1P25685 340 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 GRM5P41594 1212 aa7.03□□□□□ -1.28
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RRN3P1-201ENST00000514813 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 CETN1Q12798 172 aa7.03□□□□□ -1.28
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RRN3P1-201ENST00000514813 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 WDR44Q5JSH3 913 aa7.03□□□□□ -1.28
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RRN3P1-201ENST00000514813 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 SENP8Q96LD8 212 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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RRN3P1-201ENST00000514813 EYSQ5T1H1 3165 aa7.03□□□□□ -1.28
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RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1W2PQ27 194 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1W2PQ64 194 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1W2PQD8 194 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 PPEF2O14830 753 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 TEX28O15482 410 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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RRN3P1-201ENST00000514813 TSPY1Q01534 308 aa7.03□□□□□ -1.28
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RRN3P1-201ENST00000514813 HYIQ5T013 277 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.03□□□□□ -1.28
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RRN3P1-201ENST00000514813 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 PRO3102Q9H379 93 aa7.03□□□□□ -1.28
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RRN3P1-201ENST00000514813 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.02□□□□□ -1.29
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RRN3P1-201ENST00000514813 RTP2Q5QGT7 225 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 RASIP1Q5U651 963 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 WSCD1Q658N2 575 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF280DQ6N043 979 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ATCAYQ86WG3 371 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 RNF214Q8ND24 703 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 STKLD1Q8NE28 680 aa7.02□□□□□ -1.29
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