RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513678.5

MATR3-222, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-222	ENST00000513678	OR4Q2	P0C623	313 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	RFX1	P22670	979 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	ACOT2	P49753	483 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	PFKP	Q01813	784 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	TWF1	Q12792	350 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	GPR17	Q13304	367 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	MYBPC2	Q14324	1141 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	LEMD2	Q8NC56	503 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	PANK2	Q9BZ23	570 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	FOXQ1	Q9C009	403 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	PANK4	Q9NVE7	773 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MATR3-222	ENST00000513678	F5	P12259	2224 aa		18.21	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	CYP11A1	P05108	521 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	ODC1	P11926	461 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	IDE	P14735	1019 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	GLUL	P15104	373 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	GART	P22102	1010 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	KCNA1	Q09470	495 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	IQCE	Q6IPM2	695 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	SHC4	Q6S5L8	630 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	USP37	Q86T82	979 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	ELMOD1	Q8N336	334 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	PDILT	Q8N807	584 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	IQUB	Q8NA54	791 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	FAM212A	Q96EL1	285 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	SENP8	Q96LD8	212 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	ASB16	Q96NS5	453 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	LRRC3	Q9BY71	257 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	IL18RAP	O95256	599 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	GCNT3	O95395	438 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	CASP5	P51878	434 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	AMPD3	Q01432	767 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	TRIM9	Q9C026	710 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	TMEM206	Q9H813	350 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	ASAH2	Q9NR71	780 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	CFAP45	Q9UL16	551 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	SCN1A	P35498	2009 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	MTMR11	A4FU01	709 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	LRRN2	O75325	713 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	PLD1	Q13393	1074 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	CENPP	Q6IPU0	288 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	TMC8	Q8IU68	726 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	DNASE1L2	Q92874	299 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	COL4A2	P08572	1712 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	SHISA7	A6NL88	538 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	WNT7B	P56706	349 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	DUSP4	Q13115	394 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	SMARCD2	Q92925	531 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	TMEM209	Q96SK2	561 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	DPP3	Q9NY33	737 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MATR3-222	ENST00000513678	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		18.16	■□□□□ 0.5

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