RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 MYO16Q9Y6X6 1858 aa17.08■□□□□ 0.33
ALYREF-204ENST00000512673 ANTXRLA6NF34 631 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 H7C4K7 107 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 PODXLO00592 558 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 SOAT2O75908 522 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 ARSAP15289 507 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 PTGER3P43115 390 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 MCM2P49736 904 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 CDR1P51861 262 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 NLRP5P59047 1200 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 PLCB2Q00722 1185 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 NECTIN1Q15223 517 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 EPHA7Q15375 998 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF423Q2M1K9 1284 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 FRMD1Q8N878 549 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 DAGLBQ8NCG7 672 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 TSTD1Q8NFU3 115 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 RLN3Q8WXF3 142 aa17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 CFIP05156 583 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 GABRR2P28476 465 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 RUNX3Q13761 415 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 INF2Q27J81 1249 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF280DQ6N043 979 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 TMEFF1Q8IYR6 380 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 TMEM130Q8N3G9 435 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 HDDC3Q8N4P3 179 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 SLC39A7Q92504 469 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 UROC1Q96N76 676 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 SLC26A6Q9BXS9 759 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 FZD8Q9H461 694 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa17.07■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 SYN3O14994 580 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 USO1O60763 962 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 DUSP4Q13115 394 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 MARCH9Q86YJ5 346 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 LURAP1LQ8IV03 231 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 PRIMPOLQ96LW4 560 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 FAM83CQ9BQN1 747 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 ADPGKQ9BRR6 497 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 KCNMB3Q9NPA1 279 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 SCUBE2Q9NQ36 999 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 OBP2AQ9NY56 170 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 NUB1Q9Y5A7 615 aa17.06■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 DGAT1O75907 488 aa17.05■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 EPHB3P54753 998 aa17.05■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 OSTNP61366 133 aa17.05■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 PTPAQ15257 358 aa17.05■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 ADCK5Q3MIX3 580 aa17.05■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 TTC9BQ8N6N2 239 aa17.05■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 CEP120Q8N960 986 aa17.05■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 P2RY13Q9BPV8 354 aa17.05■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 CCL26Q9Y258 94 aa17.05■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 SLITRK3O94933 977 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 FTH1P19P0C7X4 201 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 CPA1P15085 419 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 DRD1P21728 446 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF605Q86T29 641 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 MDGA1Q8NFP4 955 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 RIN3Q8TB24 985 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 PIGOQ8TEQ8 1089 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 BSNDQ8WZ55 320 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 HAS1Q92839 578 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 TPCN1Q9ULQ1 816 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 PCDHA4Q9UN74 947 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 PTPRDP23468 1912 aa17.04■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 UPK3BL1B0FP48 263 aa17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 UPK3BL2E5RIL1 263 aa17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 SH3BP5O60239 455 aa17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 OPHN1O60890 802 aa17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 CD59P13987 128 aa17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 ITPKAP23677 461 aa17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 MCM4P33991 863 aa17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 SEC13P55735 322 aa17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 FAM187BQ17R55 369 aa17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 MOXD1Q6UVY6 613 aa17.03■□□□□ 0.32
ALYREF-204ENST00000512673 C11orf74Q86VG3 221 aa17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms