RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	RIN3	Q8TB24	985 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CASP10	Q92851	521 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MXD3	Q9BW11	206 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GBP3	Q9H0R5	595 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	VPS11	Q9H270	941 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RRAGC	Q9HB90	399 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RRN3	Q9NYV6	651 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RGL1	Q9NZL6	768 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MBD2	Q9UBB5	411 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GJD2	Q9UKL4	321 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		7.21	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0B4J269	797 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L5	A8MUK1	530 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971		L7N2F9	121 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	FZD9	O00144	591 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	GNB5	O14775	395 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	IKBKB	O14920	756 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	EXTL3	O43909	919 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	PRDM1	O75626	825 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	MICAL2	O94851	1124 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	PLAT	P00750	562 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	CD4	P01730	458 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	DNTT	P04053	509 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	ARAF	P10398	606 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	GNA15	P30679	374 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	ETFB	P38117	255 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	HADHA	P40939	763 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC12A2	P55011	1212 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT85	P78386	507 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	CD83	Q01151	205 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	CTBS	Q01459	385 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	EHHADH	Q08426	723 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	GBX1	Q14549	363 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	GRM4	Q14833	912 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	MAPRE2	Q15555	327 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	ASIC2	Q16515	512 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	EFHC2	Q5JST6	749 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAL	Q6DHV7	355 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	MCTP1	Q6DN14	999 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT74	Q7RTS7	529 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	BRAP	Q7Z569	592 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM83A	Q86UY5	434 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	DPF2	Q92785	391 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	MTMR8	Q96EF0	704 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	BTBD6	Q96KE9	485 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	ASB2	Q96Q27	587 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	EHD1	Q9H4M9	534 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM50B	Q9Y247	325 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	SIPA1L1	O43166	1804 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GUA9	196 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	CTAGE9	A4FU28	777 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	PIK3R2	O00459	728 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNJ13	O60928	360 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM127	O75204	238 aa		7.2	□□□□□ -1.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms