RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 CPB2Q96IY4 423 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 BTBD6Q96KE9 485 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 CISHQ9NSE2 258 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 SETD4Q9NVD3 440 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 GABRQQ9UN88 632 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 Q9Y3F1 56 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 AGPSO00116 658 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 THAP12O43422 761 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR32O75388 356 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 STAU1O95793 577 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 PYGMP11217 842 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 MMP8P22894 467 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 ECHS1P30084 290 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 ATICP31939 592 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 GRM5P41594 1212 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC1A1P43005 524 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM193AP78312 1265 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 PAK2Q13177 524 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 MAMLD1Q13495 774 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 HIC1Q14526 733 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 TRADDQ15628 312 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP1B1Q16678 543 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 LIN9Q5TKA1 542 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 JADE1Q6IE81 842 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 MREGQ8N565 214 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 PRELID2Q8N945 189 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC26Q8TAB7 109 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 WHAMMQ8TF30 809 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 TFAP2BQ92481 460 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 SDCBP2Q9H190 292 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 POLIQ9UNA4 740 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 NRCAMQ92823 1304 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 ANK1P16157 1881 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 EVPLQ92817 2033 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 PROSCO94903 275 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 WEE2P0C1S8 567 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM153BP0C7A2 387 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 ELNP15502 786 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 PTGIRP43119 386 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 PSEN2P49810 448 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 RWDD2BP57060 319 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 CUL1Q13616 776 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 TERF2Q15554 542 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 CCL14Q16627 93 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM153CQ494X1 144 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 AADACL2Q6P093 401 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 CD302Q8IX05 232 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 NLRP7Q8WX94 980 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R16BQ96T49 567 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM7Q9C029 511 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 LHX5Q9H2C1 402 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 MED4Q9NPJ6 270 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM153AQ9UHL3 310 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 NFU1Q9UMS0 254 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 C2CD2Q9Y426 696 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 ESYT3A0FGR9 886 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM187AA6NFU0 413 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 FSCN2O14926 492 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 SPOPO43791 374 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 PHF2O75151 1096 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 PAEPP09466 180 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 CD58P19256 250 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-209ENST00000504450 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms