RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TSPAN1O60635 241 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 F2P00734 622 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NFICP08651 508 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CD58P19256 250 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SLC1A1P43005 524 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PRMT2P55345 433 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 RWDD2BP57060 319 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 HSP90B2PQ58FF3 399 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 LIN9Q5TKA1 542 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 AADACL2Q6P093 401 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PASD1Q8IV76 773 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MREGQ8N565 214 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 WHAMMQ8TF30 809 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 IFT81Q8WYA0 676 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 USP6NLQ92738 828 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf70Q9BRQ4 267 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 BCO2Q9BYV7 579 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 37.7
PDE4D-208ENST00000502484 SCN1AP35498 2009 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MYO1FO00160 1098 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ERLIN2O94905 339 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PYGMP11217 842 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ECHS1P30084 290 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CDC42EP1Q00587 391 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 JADE1Q6IE81 842 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CXorf38Q8TB03 319 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 APBA2Q99767 749 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SCINQ9Y6U3 715 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NRCAMQ92823 1304 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 AGPSO00116 658 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TTI1O43156 1089 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PHF2O75151 1096 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 WEE2P0C1S8 567 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ELNP15502 786 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MMP8P22894 467 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MAMLD1Q13495 774 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TRADDQ15628 312 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CCL14Q16627 93 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 C2CD6Q53TS8 623 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF667Q5HYK9 610 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 KAT2BQ92831 832 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SCLT1Q96NL6 688 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PLVAPQ9BX97 442 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM7Q9C029 511 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SETD4Q9NVD3 440 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.72□□□□□ -1.01
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PDE4D-208ENST00000502484 KRT19P08727 400 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 FAM153BP0C7A2 387 aa8.71□□□□□ -1.01
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PDE4D-208ENST00000502484 FAM153CQ494X1 144 aa8.71□□□□□ -1.01
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PDE4D-208ENST00000502484 TLK2Q86UE8 772 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PRELID2Q8N945 189 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ACAP3Q96P50 834 aa8.71□□□□□ -1.01
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