RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SENP6-211ENST00000493959 SRFP11831 508 aa24.51■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CEBPBP17676 345 aa24.51■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 ALCAMQ13740 583 aa24.51■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 PRSS36Q5K4E3 855 aa24.51■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 ATAD1Q8NBU5 361 aa24.51■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.51■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.51■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 WNT16Q9UBV4 365 aa24.51■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 OR6C75A6NL08 312 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CYB561D2O14569 222 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 IL18RAPO95256 599 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 ODC1P11926 461 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 AMPD3Q01432 767 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 GPR17Q13304 367 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 ATL3Q6DD88 541 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 OR10T2Q8NGX3 314 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 KXD1Q9BQD3 176 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 TMEM206Q9H813 350 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CFAP45Q9UL16 551 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 EXTL3O43909 919 aa24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 GJA1P17302 382 aa24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 AFMP43652 599 aa24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 TAF6P49848 677 aa24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CLCN5P51795 746 aa24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 WSCD1Q658N2 575 aa24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CENPPQ6IPU0 288 aa24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 TTC9BQ8N6N2 239 aa24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.49■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 MOSPD3O75425 235 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 SOAT2O75908 522 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CYP11A1P05108 521 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CUL4BQ13620 913 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 ZSWIM3Q96MP5 696 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 FAM86C1Q9NVL1 165 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 MAFFQ9ULX9 164 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 YIPF1Q9Y548 306 aa24.48■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 F5P12259 2224 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 H0Y858 1186 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 STK25O00506 426 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 MYL4P12829 197 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 PTPN5P54829 565 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 EHHADHQ08426 723 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 MYBPC2Q14324 1141 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 TANGO2Q6ICL3 276 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 LRRTM3Q86VH5 581 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 GPD1LQ8N335 351 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CXorf38Q8TB03 319 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 TCHHQ07283 1943 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 MTMR11A4FU01 709 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 KPNA7A9QM74 516 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 TGFB1I1O43294 461 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 ITGB3P05106 788 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 PAX3P23760 479 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CYP4A22Q5TCH4 519 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 IQCEQ6IPM2 695 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 UNC13DQ70J99 1090 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 MTSS1LQ765P7 747 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 SCFD1Q8WVM8 642 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 PRRX2Q99811 253 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
SENP6-211ENST00000493959 PTPRJQ12913 1337 aa24.45■■□□□ 1.5
SENP6-211ENST00000493959 CLIC2O15247 247 aa24.45■■□□□ 1.5
SENP6-211ENST00000493959 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SENP6-211ENST00000493959 AOC1P19801 751 aa24.45■■□□□ 1.5
SENP6-211ENST00000493959 SLC39A12Q504Y0 691 aa24.45■■□□□ 1.5
SENP6-211ENST00000493959 FAM78AQ5JUQ0 283 aa24.45■■□□□ 1.5
SENP6-211ENST00000493959 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms