RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WV62 115 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 NBNO60934 754 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA7P48741 367 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 SLC11A2P49281 568 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 RNF44Q7L0R7 432 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MPP5Q8N3R9 675 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 SLC15A4Q8N697 577 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 OR14A2Q96R54 314 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 M0QYG6 137 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 AREL1O15033 823 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 GRM1Q13255 1194 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MPEG1Q2M385 716 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF527Q8NB42 609 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA5Q8NB90 893 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 CCT6BQ92526 530 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 SCLT1Q96NL6 688 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MOGAT1Q96PD6 335 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 DRGXA6NNA5 263 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 FFAR2O15552 330 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2C9P11712 490 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 UCP3P55916 312 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 UNC13DQ70J99 1090 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 MED25Q71SY5 747 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 YAF2Q8IY57 180 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 D2HGDHQ8N465 521 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 RNF169Q8NCN4 708 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 TMIEQ8NEW7 156 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL32Q96NJ5 620 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 XPR1Q9UBH6 696 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CLCA1A8K7I4 914 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G6O60733 806 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 RAD17O75943 681 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ITGB1P05556 798 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CKBP12277 381 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 WNT3P56703 355 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 HHEXQ03014 270 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 PIGFQ07326 219 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 TCF15Q12870 199 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SPSB4Q96A44 273 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 MIEF2Q96C03 454 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 GNRHR2Q96P88 292 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 STK31Q9BXU1 1019 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CHST8Q9H2A9 424 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF536O15090 1300 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC189A1A4V9 331 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 NPHP1O15259 732 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 RASSF9O75901 435 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 INMTO95050 263 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 MYL4P12829 197 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A2P23975 617 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 GRK6P43250 576 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 BLMHQ13867 455 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC174Q6PII3 467 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CPXCR1Q8N123 301 aa9.19□□□□□ -0.94
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