RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 SPATC1LQ9H0A9 340 aa17.88■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 STRNO43815 780 aa17.88■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 TTC30AQ86WT1 665 aa17.88■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 SLC7A14Q8TBB6 771 aa17.88■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.451e-8■■■■■ 34.6
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NISCH-213ENST00000489895 CDH16O75309 829 aa17.88■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 CCDC138Q96M89 665 aa17.88■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 MRIQ9BWK5 157 aa17.88■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 H7C4K7 107 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 THPOP40225 353 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 DCAF6Q58WW2 860 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC6O75061 913 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 ARHGDIAP52565 204 aa17.87■□□□□ 0.45
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NISCH-213ENST00000489895 GPC2Q8N158 579 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 ANP32DO95626 131 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 MAPRE2Q15555 327 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 KRT80Q6KB66 452 aa17.87■□□□□ 0.45
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NISCH-213ENST00000489895 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 CALML6Q8TD86 181 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 OPTNQ96CV9 577 aa17.87■□□□□ 0.45
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NISCH-213ENST00000489895 PI4K2AQ9BTU6 479 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 KIFC3Q9BVG8 833 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 VDRP11473 427 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 HARS2P49590 506 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 BFSP2Q13515 415 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 NLRP14Q86W24 1093 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 NEU2Q9Y3R4 380 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 SPAG7O75391 227 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
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NISCH-213ENST00000489895 DACT2Q5SW24 774 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 SH3KBP1Q96B97 665 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 CDR2Q01850 454 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 PKN1Q16512 942 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 C3orf67Q6ZVT6 689 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 ZNF720Q7Z2F6 126 aa17.86■□□□□ 0.45
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NISCH-213ENST00000489895 OLFML3Q9NRN5 406 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 NFIBO00712 420 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 ZNF185O15231 689 aa17.86■□□□□ 0.45
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NISCH-213ENST00000489895 IL31Q6EBC2 164 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 SPATA18Q8TC71 538 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 CENPKQ9BS16 269 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 CARD9Q9H257 536 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 DIAPH2O60879 1101 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 PGK2P07205 417 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 KLRC1P26715 233 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 HERVK_113P62684 666 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 PBXIP1Q96AQ6 731 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 MS4A14Q96JA4 679 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 NAGPAQ9UK23 515 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 DCDC2CA8MYV0 355 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.452e-10■□□□□ 10.2
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NISCH-213ENST00000489895 DNAJC7Q99615 494 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 TRABDQ9H4I3 376 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 27.6
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NISCH-213ENST00000489895 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 FGFR4P22455 802 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 ATICP31939 592 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 TAF11Q15544 211 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 DSEQ9UL01 958 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 RSPH10B2B2RC85 870 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 RSPH10BP0C881 870 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 STMN1P16949 149 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 GTF2H3Q13889 308 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 PGM5Q15124 567 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 ANKMY2Q8IV38 441 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 NCLNQ969V3 563 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 WWP1Q9H0M0 922 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 MUC3BQ9H195 1237 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
NISCH-213ENST00000489895 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa17.85■□□□□ 0.45
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