RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM221	A6NGB7	291 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876		M0R296	226 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CYB561D2	O14569	222 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	PRRG1	O14668	218 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	XYLB	O75191	536 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	ELF1	P32519	619 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	NUCB2	P80303	420 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	TPGS2	Q68CL5	300 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	ASIC4	Q96FT7	647 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF233	A6NK53	670 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CYP11A1	P05108	521 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	KRT19	P08727	400 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	POU2F2	P09086	479 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	DPYD	Q12882	1025 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	SV2C	Q496J9	727 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	ING5	Q8WYH8	240 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF560	Q96MR9	790 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	OR6C75	A6NL08	312 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	SOAT2	O75908	522 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF202	O95125	648 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	LRG1	P02750	347 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	RHO	P08100	348 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	LAMP2	P13473	410 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	TWF1	Q12792	350 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	BFSP1	Q12934	665 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	GPR17	Q13304	367 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	FGF13	Q92913	245 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CEP72	Q9P209	647 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	HCRT	O43612	131 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	MYL1	P05976	194 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	PAX3	P23760	479 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CCR2	P41597	374 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CASP4	P49662	377 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	DUSP4	Q13115	394 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	PSMD2	Q13200	908 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	HTR4	Q13639	388 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		13.9	□□□□□ -0.18

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