RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF410Q86VK4 478 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CEP57Q86XR8 500 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 NAXDQ8IW45 347 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 HACE1Q8IYU2 909 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 KCNB2Q92953 911 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 MED8Q96G25 268 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SPACA7Q96KW9 195 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 NOTCH4Q99466 2003 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CORO1BQ9BR76 489 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 FAM117AQ9C073 453 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.67□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ARHGAP33O14559 1287 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ZBTB39O15060 712 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 B4GALT5O43286 388 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TSPAN1O60635 241 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CDC45O75419 566 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 IFNAR1P17181 557 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 RPS6KB1P23443 525 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 GNA11P29992 359 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 OR1D2P34982 312 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 UCNP55089 124 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CXADRP78310 365 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CAMK2BQ13554 666 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 DMC1Q14565 340 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 EMC2Q15006 297 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 INF2Q27J81 1249 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 WHAMMQ8TF30 809 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 NXPE2Q96DL1 559 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CPB2Q96IY4 423 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CDC6Q99741 560 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 MIOSQ9NXC5 875 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 OBP2AQ9NY56 170 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 INVSQ9Y283 1065 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 IPPQ9Y573 584 aa8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ARL5CA6NH57 179 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 RNF40O75150 1001 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ALDH1A2O94788 518 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 HSPA4P34932 840 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 NLRP5P59047 1200 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 KRT32Q14532 448 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 AMHR2Q16671 573 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 C2orf27AQ580R0 203 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 RTP2Q5QGT7 225 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 BROXQ5VW32 411 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 RDM1Q8NG50 284 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 OXER1Q8TDS5 423 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 HASPINQ8TF76 798 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 CAMK1GQ96NX5 476 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 GBP4Q96PP9 640 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 LXNQ9BS40 222 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 PILRBQ9UKJ0 227 aa8.65□□□□□ -1.02
SZRD1-208ENST00000476423 APC2O95996 2303 aa8.64□□□□□ -1.03
SZRD1-208ENST00000476423 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.64□□□□□ -1.03
SZRD1-208ENST00000476423 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms