RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 CCDC83Q8IWF9 413 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 FLCNQ8NFG4 579 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 WNT8BQ93098 351 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 VPS50Q96JG6 964 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 SYT15Q9BQS2 421 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 CENPKQ9BS16 269 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 NDST4Q9H3R1 872 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 BTBD7Q9P203 1132 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 E9PCH4 1651 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.36□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 NOTOA8MTQ0 251 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM114B3SHH9 223 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 HIP1O00291 1037 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 RGS13O14921 159 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 PLSCR1O15162 318 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 FKBP9O95302 570 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 KRT6AP02538 564 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 KRT6BP04259 564 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 GNAI3P08754 354 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 GYS1P13807 737 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 HSD17B2P37059 387 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 NEK4P51957 841 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ATP8B2P98198 1209 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 GBE1Q04446 702 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 CETN1Q12798 172 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF460Q14592 562 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 KRT71Q3SY84 523 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 C8orf74Q6P047 294 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 NLRP14Q86W24 1093 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 PASD1Q8IV76 773 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 AHI1Q8N157 1196 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 AGAP11Q8TF27 550 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 CEP19Q96LK0 163 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 WDR18Q9BV38 432 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 JCADQ9P266 1359 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 CEP152O94986 1710 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A088AWK7 358 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 SYCE1LA8MT33 242 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 RASA4BC9J798 803 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 NDC80O14777 642 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 GPR39O43194 453 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 PPIP5K2O43314 1243 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 CAPNS1P04632 268 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 C8AP07357 584 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 PYGMP11217 842 aa6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ECHDC1-215ENST00000475319 LSP1P33241 339 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms