RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 ABHD17CQ6PCB6 329 aa1.9□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 RHBDF2Q6PJF5 856 aa1.9□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 HES6Q96HZ4 224 aa1.9□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 BACH2Q9BYV9 841 aa1.9□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa1.9□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ARHGEF3Q9NR81 526 aa1.9□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 GSG1L2A8MUP6 293 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 APPP05067 770 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 FCER1AP12319 257 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ATP5JP18859 108 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 CTSSP25774 331 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 SP140Q13342 867 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 BMPR2Q13873 1038 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF529Q6P280 563 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ANKRD16Q6P6B7 361 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ADGRG5Q8IZF4 528 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 SIGLEC11Q96RL6 698 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 CD93Q9NPY3 652 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 DKK3Q9UBP4 350 aa1.89□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 H0YIZ8 118 aa1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 TLR2O60603 784 aa1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 RAP2AP10114 183 aa1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 PRG2P13727 222 aa1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ERCC3P19447 782 aa1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 CDC25AP30304 524 aa1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF174Q15697 407 aa1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 FAM209AQ5JX71 171 aa1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF813Q6ZN06 617 aa1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 CDC6Q99741 560 aa1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 NEU2Q9Y3R4 380 aa1.88□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 H7C1D1 291 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 USP1O94782 785 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF91Q05481 1191 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF449Q6P9G9 518 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 DEF8Q6ZN54 512 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 FITM2Q8N6M3 262 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 CYP2W1Q8TAV3 490 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ASB5Q8WWX0 329 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 SNX19Q92543 992 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 FKBP10Q96AY3 582 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ZFYVE19Q96K21 471 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 SLC52A2Q9HAB3 445 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF556Q9HAH1 456 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM184CQ9NVA4 438 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa1.87□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 SCNN1BP51168 640 aa1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 CYP4F2P78329 520 aa1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ADAM5Q6NVV9 412 aa1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 IQCF1Q8N6M8 205 aa1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF485Q8NCK3 441 aa1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 NEUROG1Q92886 237 aa1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 MACROD1Q9BQ69 325 aa1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 SPRY4Q9C004 299 aa1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ST7Q9NRC1 585 aa1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 SLC9A1P19634 815 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 PPARAQ07869 468 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 NADSYN1Q6IA69 706 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 TRIM72Q6ZMU5 477 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 MMP21Q8N119 569 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 GALNT4Q8N4A0 578 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 GSTCDQ8NEC7 633 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 LMO3Q8TAP4 145 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 MPLKIPQ8TAP9 179 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 GIPC2Q8TF65 315 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 RMI1Q9H9A7 625 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 PI4KBQ9UBF8 816 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 SLC23A1Q9UHI7 598 aa1.85□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1B0GU03 582 aa1.84□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 CDHR4A6H8M9 788 aa1.84□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 QSOX1O00391 747 aa1.84□□□□□ -2.11
SHQ1-204ENST00000468347 ADCY3O60266 1144 aa1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms