RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PQ64 194 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PQC6 194 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PQD8 194 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PRG0 241 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TUSC2O75896 110 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASNSP08243 561 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYBP10242 640 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP2C8P10632 490 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CETPP11597 493 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYH8P13535 1937 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC16A1P53985 500 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RTP1P59025 263 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HERVK_113P62684 666 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM193AP78312 1265 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRHR2Q13324 411 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRT72Q14CN4 511 aa9.69□□□□□ -0.86
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BMP2KLQ5H9B9 411 aa9.69□□□□□ -0.86
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SRLQ86TD4 932 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DENND1CQ8IV53 801 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR18Q8N4B5 295 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM156AQ8NDB6 213 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FERMT2Q96AC1 680 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COA7Q96BR5 231 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POFUT1Q9H488 388 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYOTQ9UBF9 498 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBLN5Q9UBX5 448 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SWAP70Q9UH65 585 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRSS38A1L453 326 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDHXO00330 501 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GSC2O15499 205 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SGSM2O43147 1006 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP26A1O43174 497 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NMT2O60551 498 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PEX10O60683 326 aa9.68□□□□□ -0.86
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHRNA4P43681 627 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.68□□□□□ -0.86
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CXCL11O14625 94 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BACE1P56817 501 aa9.67□□□□□ -0.86
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ICA1Q05084 483 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LLGL1Q15334 1064 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALX1Q15699 326 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANO4Q32M45 955 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTC38Q5R3I4 469 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM179Q6ZVK1 233 aa9.67□□□□□ -0.86
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEC14L1Q92503 715 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GBP4Q96PP9 640 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CPA4Q9UI42 421 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DMTF1Q9Y222 760 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASB1Q9Y576 335 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WIPF1O43516 503 aa9.66□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LPLP06858 475 aa9.66□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SETSIPP0DME0 302 aa9.66□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TFAP4Q01664 338 aa9.66□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LONRF1Q17RB8 773 aa9.66□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PGS1Q32NB8 556 aa9.66□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.66□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANO1Q5XXA6 986 aa9.66□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALNT18Q6P9A2 607 aa9.66□□□□□ -0.86
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