RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441455.1

RPSAP20-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP20, Length 890 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP20-201ENST00000441455 CCDC122Q5T0U0 273 aa11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 CNKSR3Q6P9H4 555 aa11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 GLB1LQ6UWU2 654 aa11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 RABGGTAQ92696 567 aa11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 SYT11Q9BT88 431 aa11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 PDCL3Q9H2J4 239 aa11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 CNTN6Q9UQ52 1028 aa11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa11.28□□□□□ -0.6
RPSAP20-201ENST00000441455 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 TRIM43BA6NCK2 446 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 SPTLC1O15269 473 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 TIMP1P01033 207 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 CHRNB2P17787 502 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 ITGB8P26012 769 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 RFC2P35250 354 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 ZNF132P52740 706 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 FMO1Q01740 532 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 CDR2Q01850 454 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 ORC1Q13415 861 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 TUSC3Q13454 348 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 PTPN14Q15678 1187 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 PALB2Q86YC2 1186 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 ABI1Q8IZP0 508 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 SLC30A5Q8TAD4 765 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 PAAF1Q9BRP4 392 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 NAGPAQ9UK23 515 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 CEP350Q5VT06 3117 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 TSC2P49815 1807 aa11.27□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 RCCD1A6NED2 376 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 KIAA0355O15063 1070 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 INPPL1O15357 1258 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 KRT86O43790 486 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 CILPO75339 1184 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 ABL1P00519 1130 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 CD19P15391 556 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 CSF2RAP15509 400 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 ARHGAP25P42331 645 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 GATMP50440 423 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 NDST1P52848 882 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 KIF5AQ12840 1032 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 IKBKEQ14164 716 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 ZNF677Q86XU0 584 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 TMEM199Q8N511 208 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 OR6B3Q8NGW1 331 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 WHAMMQ8TF30 809 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 HASPINQ8TF76 798 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 UROC1Q96N76 676 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 TWNKQ96RR1 684 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 PACSIN1Q9BY11 444 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 ELOVL4Q9GZR5 314 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 GDAP2Q9NXN4 497 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 NENFQ9UMX5 172 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 GUCA1BQ9UMX6 200 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 TET1Q8NFU7 2136 aa11.26□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 CYB561D2O14569 222 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 HOXA2O43364 376 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 HUS1O60921 280 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 DDHD2O94830 711 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 UPP2O95045 317 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 H2AFZP0C0S5 128 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 TNNT1P13805 278 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 RAD23BP54727 409 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 LILRA4P59901 499 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 INCA1Q0VD86 236 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 UPP1Q16831 310 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 SOWAHAQ2M3V2 549 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 C10orf76Q5T2E6 689 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 H2AFVQ71UI9 128 aa11.25□□□□□ -0.61
RPSAP20-201ENST00000441455 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms