RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 DNM3Q9UQ16 869 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 MTMR6Q9Y217 621 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 USP27XA6NNY8 438 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SMTNP53814 917 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ST3GAL1Q11201 340 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 TTC38Q5R3I4 469 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 CEP135Q66GS9 1140 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SMARCD2Q92925 531 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SMARCE1Q969G3 411 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 LOXL4Q96JB6 756 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 C8orf76Q96K31 380 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 CFAP45Q9UL16 551 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 TRIP11Q15643 1979 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 WDR27A2RRH5 827 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 POTEMA6NI47 508 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 M0QZQ0 153 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 PODXLO00592 558 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 PRRG1O14668 218 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 AKAP3O75969 853 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 PSMC3P17980 439 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 TYMPP19971 482 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 LRPAP1P30533 357 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 SATB1Q01826 763 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ROR1Q01973 937 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 STRN3Q13033 797 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 HYIQ5T013 277 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 KRT79Q5XKE5 535 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ITFG1Q8TB96 612 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 NETO1Q8TDF5 533 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 RMDN1Q96DB5 314 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 DERAQ9Y315 318 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 R4GN57 208 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRR-204ENST00000440835 MYH11P35749 1972 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRR-204ENST00000440835 F8W810 466 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CHADO15335 359 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 JAK2O60674 1132 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 TOM1L1O75674 476 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 OAZ2O95190 189 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ADRB2P07550 413 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 RETP07949 1114 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRR-204ENST00000440835 CLCNKBP51801 687 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 POTEGQ6S5H5 508 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ITIH5Q86UX2 942 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 PACS2Q86VP3 889 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRR-204ENST00000440835 B3GALT6Q96L58 329 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRR-204ENST00000440835 HINFPQ9BQA5 517 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 FOXQ1Q9C009 403 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CDT1Q9H211 546 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ASAH2Q9NR71 780 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CEP83Q9Y592 693 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CACNA1AO00555 2505 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 FAM205CA6NFA0 338 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CLTAP09496 248 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC172P0C7W6 258 aa6.51□□□□□ -1.37
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