RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431317.6

ARID4A-206, Transcript of AT-rich interaction domain 4A, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID4A, Length 5,783 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID4A-206	ENST00000431317	TLR2	O60603	784 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	CCDC22	O60826	627 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	DLG4	P78352	724 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	ASTN1	O14525	1302 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	PROSC	O94903	275 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	TMC2	Q8TDI7	906 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	SPC25	Q9HBM1	224 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	NDE1	Q9NXR1	346 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	HUS1	O60921	280 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	LCP1	P13796	627 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	NME3	Q13232	169 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	PID1	Q7Z2X4	250 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	UBA3	Q8TBC4	463 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	AP2B1	P63010	937 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	BFAR	Q9NZS9	450 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	LTN1	O94822	1766 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	KIF3C	O14782	793 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	HAO1	Q9UJM8	370 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	ORC1	Q13415	861 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	FSCB	Q5H9T9	825 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	STYK1	Q6J9G0	422 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	MREG	Q8N565	214 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	RDM1	Q8NG50	284 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	PPCS	Q9HAB8	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	ZFAT	Q9P243	1243 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	SHBG	P04278	402 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	CPA2	P48052	419 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	CD302	Q8IX05	232 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	MAGEB18	Q96M61	343 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	ASAP2	O43150	1006 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	MAP3K6	O95382	1288 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	SLC4A1	P02730	911 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	OAT	P04181	439 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	GART	P22102	1010 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	CCNG2	Q16589	344 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-206	ENST00000431317	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.55	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms