RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428457.1

TNS3-204, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS3, Length 5,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-204ENST00000428457 PHTF1Q9UMS5 762 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 MAP2K7O14733 419 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 AIM2O14862 343 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 PDE5AO76074 875 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 SEMA3FQ13275 785 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 GJB7Q6PEY0 223 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 THNSL1Q8IYQ7 743 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 SUN2Q9UH99 717 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 PLAGL2Q9UPG8 496 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 C15orf41Q9Y2V0 281 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 ALG6Q9Y672 507 aa10.49□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 A0A0U1RQJ8 604 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 CPB1P15086 417 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 MAGEA4P43358 317 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 DSG1Q02413 1049 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 RAD51Q06609 339 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 TFDP2Q14188 446 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 KRT39Q6A163 491 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 FUKQ8N0W3 1084 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 SOCS4Q8WXH5 440 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 CNBD2Q96M20 576 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 ADNPQ9H2P0 1102 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 E2F8A0AVK6 867 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 CYBBP04839 570 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 SOX11P35716 441 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 GLB1LQ6UWU2 654 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 USP6NLQ92738 828 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 C18orf8Q96DM3 657 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 C7orf25Q9BPX7 421 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 IQGAP1P46940 1657 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 RTN2O75298 545 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 GNA15P30679 374 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 CEP55Q53EZ4 464 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 C16orf86Q6ZW13 317 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 NLRP9Q7RTR0 991 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 CATSPER1Q8NEC5 780 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 GIPC2Q8TF65 315 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 ERGIC2Q96RQ1 377 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 TUFT1Q9NNX1 390 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 PCMTD2Q9NV79 361 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 HPSEQ9Y251 543 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 ST3GAL1Q11201 340 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 GNASQ5JWF2 1037 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 KLC3Q6P597 504 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 DNAAF5Q86Y56 855 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 RDM1Q8NG50 284 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 PARD3BQ8TEW8 1205 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 DACH2Q96NX9 599 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 KIFC3Q9BVG8 833 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 TMEM117Q9H0C3 514 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 HEY2Q9UBP5 337 aa10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 ATP9AO75110 1047 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 DAB1O75553 588 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 DGKIO75912 1065 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 SMARCA1P28370 1054 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 ROR1Q01973 937 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 STX3Q13277 289 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 FAM83AQ86UY5 434 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 SCN4BQ8IWT1 228 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 FBXO25Q8TCJ0 367 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 MIEF2Q96C03 454 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 OLFML3Q9NRN5 406 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 IP6K2Q9UHH9 426 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 KIF1AQ12756 1690 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 RPS6KA5O75582 802 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 RPS6P62753 249 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 CAAP1Q9H8G2 361 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 AKAP10O43572 662 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 NDUFB10O96000 172 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 CACNA2D1P54289 1103 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 HDAC4P56524 1084 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 BTNL9Q6UXG8 535 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 SH3TC2Q8TF17 1288 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 CPA5Q8WXQ8 436 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 CAVIN3Q969G5 261 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 STK33Q9BYT3 514 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 MANSC1Q9H8J5 431 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS3-204ENST00000428457 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms