RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 LCORLQ8N3X6 602 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 SLC44A3Q8N4M1 653 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 AOPEPQ8N6M6 819 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 RNF31Q96EP0 1072 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 FAM167AQ96KS9 214 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 LRFN3Q9BTN0 628 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 SARGQ9BW04 601 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 PACSIN1Q9BY11 444 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM60Q9H2L4 133 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 WDCPQ9H6R7 721 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 DKK2Q9UBU2 259 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 CPA4Q9UI42 421 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 COL4A3Q01955 1670 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 GAGE12BA1L429 117 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 F2RL2O00254 374 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-208ENST00000427110 NOMO3P69849 1222 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 FAM193AP78312 1265 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 GPSM2P81274 684 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 RHDQ02161 417 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-208ENST00000427110 UBXN2BQ14CS0 331 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 MAP9Q49MG5 647 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-208ENST00000427110 CCDC93Q567U6 631 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 NOMO2Q5JPE7 1267 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-208ENST00000427110 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-208ENST00000427110 A0A088AWK7 358 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 DIRC3C9JPN6 131 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-208ENST00000427110 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 KITP10721 976 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-208ENST00000427110 SCAPQ12770 1279 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 FOXI1Q12951 378 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 PICALMQ13492 652 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 BRD3Q15059 726 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 DACT2Q5SW24 774 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 SYCP2LQ5T4T6 812 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 OLFML1Q6UWY5 402 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
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