RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ATP5DP30049 168 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SLC8A1P32418 973 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 FSTL1Q12841 308 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 PLSCR1O15162 318 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 DIAPH2O60879 1101 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 KCNA2P16389 499 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 KRT15P19012 456 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SFNP31947 248 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SLC1A1P43005 524 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 PTP4A2Q12974 167 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CCNG2Q16589 344 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 LIN9Q5TKA1 542 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 MAML1Q92585 1016 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 LIASO43766 372 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 EXTL3O43909 919 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 TNFSF9P41273 254 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 PLCB3Q01970 1234 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 NAA25Q14CX7 972 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SLC1A5Q15758 541 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC89Q8N998 374 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ERP27Q96DN0 273 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 MAGEB18Q96M61 343 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 EURLQ9NYK6 297 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 FBXO40Q9UH90 709 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.9□□□□□ -0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CFAP73A6NFT4 308 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 GOLGA8RI6L899 631 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 GTF2H1P32780 548 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 ACTR2P61160 394 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 ORC1Q13415 861 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 MTFR1Q15390 333 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 ZBTB33Q86T24 672 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 IFT74Q96LB3 600 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 TIPINQ9BVW5 301 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 TRABDQ9H4I3 376 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 PSTPIP1O43586 416 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 MSH2P43246 934 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 SP2Q02086 613 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 STRN3Q13033 797 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 EMC2Q15006 297 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 TRABD2AQ86V40 505 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 HAO1Q9UJM8 370 aa14.89□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 LRRD1A4D1F6 860 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 VWA5AO00534 786 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 TBC1D12O60347 775 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 GARTP22102 1010 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 MAN1A1P33908 653 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 GDF10P55107 478 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 PSMD6Q15008 389 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 USP37Q86T82 979 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CNGA3-204ENST00000409937 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms