RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 CD44P16070 742 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
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GNPTAB-202ENST00000392919 MYADMQ96S97 322 aa29.35■■■□□ 2.29
GNPTAB-202ENST00000392919 NUP62CLQ9H1M0 184 aa29.35■■■□□ 2.29
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GNPTAB-202ENST00000392919 CYP24A1Q07973 514 aa29.34■■■□□ 2.29
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GNPTAB-202ENST00000392919 KCNK12Q9HB15 430 aa29.34■■■□□ 2.29
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GNPTAB-202ENST00000392919 SURF1Q15526 300 aa29.32■■■□□ 2.28
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GNPTAB-202ENST00000392919 KCNH6Q9H252 994 aa29.32■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 DPP3Q9NY33 737 aa29.32■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 DOCK8Q8NF50 2099 aa29.32■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 ANO9A1A5B4 782 aa29.31■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 TRAPPC3O43617 180 aa29.31■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 NR2F2P24468 414 aa29.31■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 EDRF1Q3B7T1 1238 aa29.31■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 C9orf57Q5W0N0 161 aa29.31■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHO2Q8TD55 490 aa29.31■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 PIRO00625 290 aa29.3■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 NTHL1P78549 312 aa29.3■■■□□ 2.28
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GNPTAB-202ENST00000392919 TDGQ13569 410 aa29.3■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 STIM1Q13586 685 aa29.3■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 PPM1LQ5SGD2 360 aa29.3■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 LIN9Q5TKA1 542 aa29.3■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP135Q66GS9 1140 aa29.3■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD40Q6AI12 368 aa29.3■■■□□ 2.28
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GNPTAB-202ENST00000392919 C1orf127Q8N9H9 656 aa29.3■■■□□ 2.28
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GNPTAB-202ENST00000392919 CCNE1P24864 410 aa29.29■■■□□ 2.28
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GNPTAB-202ENST00000392919 WDR49Q8IV35 697 aa29.29■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 CXorf38Q8TB03 319 aa29.29■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 MTMR12Q9C0I1 747 aa29.29■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 EPS15L1Q9UBC2 864 aa29.29■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM49BA6NDI0 452 aa29.28■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 NARSO43776 548 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
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GNPTAB-202ENST00000392919 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP29.28■■■□□ 2.28
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GNPTAB-202ENST00000392919 SUSD3Q96L08 255 aa29.28■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 FNBP1Q96RU3 617 aa29.28■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 CGRRF1Q99675 332 aa29.28■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 TSG101Q99816 390 aa29.28■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa29.28■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 MAPK13O15264 365 aa29.27■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP29.27■■■□□ 2.28
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GNPTAB-202ENST00000392919 DUOXA2Q1HG44 320 aa29.27■■■□□ 2.28
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GNPTAB-202ENST00000392919 EEF2KMTQ96G04 330 aa29.27■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa29.27■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 IGSF9Q9P2J2 1179 aa29.27■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 POLIQ9UNA4 740 aa29.27■■■□□ 2.28
GNPTAB-202ENST00000392919 SPTLC1O15269 473 aa29.26■■■□□ 2.27
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