RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380298.2

SLC22A23-201, Transcript of solute carrier family 22 member 23, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A23, Length 1,574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A23-201ENST00000380298 GDPD5Q8WTR4 605 aa29.54■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 RBSNQ9H1K0 784 aa29.54■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 URODP06132 367 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 TKTP29401 623 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 FANCCQ00597 558 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 CAMK1Q14012 370 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 PTPROQ16827 1216 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 TMC7Q7Z402 723 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 LIMS2Q7Z4I7 341 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 TMEM86AQ8N2M4 240 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 TCF25Q9BQ70 676 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 LPXNO60711 386 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 LRRN2O75325 713 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 ERVFC1P60507 584 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 GRIN2CQ14957 1233 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 RTP2Q5QGT7 225 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 KIAA0319Q5VV43 1072 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 SPOPLQ6IQ16 392 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 PIK3R5Q8WYR1 880 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 MMS19Q96T76 1030 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 CRACR2AQ9BSW2 395 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 NIF3L1Q9GZT8 377 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 IRAK3Q9Y616 596 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 SOWAHAQ2M3V2 549 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 ANKS3Q6ZW76 656 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 METTL23Q86XA0 190 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 NT5C1BQ96P26 610 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 L1RE1Q9UN81 338 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC22A23-201ENST00000380298 A0A1B0GTH6 734 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 RFXAPO00287 272 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 FSCN2O14926 492 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 OAZ2O95190 189 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 UBXN1Q04323 297 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 B3GALT6Q96L58 329 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 PRDM12Q9H4Q4 367 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 LMCD1Q9NZU5 365 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 TACC1O75410 805 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 PON1P27169 355 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 WSCD1Q658N2 575 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 TRIM65Q6PJ69 517 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 PDCL2Q8N4E4 241 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 CYP3A43Q9HB55 503 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP29.5■■■□□ 2.316e-7■■■■■ 126.4
SLC22A23-201ENST00000380298 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 POLIQ9UNA4 740 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 H7C4K7 107 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 CXCL14O95715 111 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 ASPAP45381 313 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 CREMQ03060 361 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 PTPN14Q15678 1187 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 OVOS1Q6IE37 1185 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 ADGRF2Q8IZF7 708 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 TATDN2Q93075 761 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 ELMO3Q96BJ8 720 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 BCO2Q9BYV7 579 aa29.49■■■□□ 2.31
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SLC22A23-201ENST00000380298 SLC9A1P19634 815 aa29.48■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 LHX1P48742 406 aa29.48■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 UBASH3AP57075 661 aa29.48■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 KCNMA1Q12791 1236 aa29.48■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 FAM81BQ96LP2 452 aa29.48■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 ERGIC2Q96RQ1 377 aa29.48■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 BACE2Q9Y5Z0 518 aa29.48■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 LRMPQ12912 555 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 NR1I3Q14994 352 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF280DQ6N043 979 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 THEM5Q8N1Q8 247 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 RXFP1Q9HBX9 757 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 C2CD2LO14523 706 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 GABRDO14764 452 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 WARSP23381 471 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 IRS1P35568 1242 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 GCNT1Q02742 428 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 CUL2Q13617 745 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 PSMD5Q16401 504 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 PLPP4Q5VZY2 271 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC22A23-201ENST00000380298 TTC39CQ8N584 583 aa29.47■■■□□ 2.31
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