RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 LINC00301Q8NCQ3 95 aa15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 BEST2Q8NFU1 509 aa15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 EPC1Q9H2F5 836 aa15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 YIPF1Q9Y548 306 aa15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 ASB3Q9Y575 518 aa15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 K7ENM7 598 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 FAM13AO94988 1023 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 FCARP24071 287 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 EPHA5P54756 1037 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 SLC12A3P55017 1021 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 MYBPC2Q14324 1141 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 VEPH1Q14D04 833 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 SEZ6Q53EL9 994 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 OVOS1Q6IE37 1185 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 MFSD6LQ8IWD5 586 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 DCLK2Q8N568 766 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 MYCT1Q8N699 235 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 CHAMP1Q96JM3 812 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 GCNAQ96QF7 691 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 CHRDQ9H2X0 955 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 TRPV4Q9HBA0 871 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa15.24■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 ANK1P16157 1881 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 COL4A3Q01955 1670 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 TTC26A0AVF1 554 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 OGTO15294 1046 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 TBCAO75347 108 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 TYMPP19971 482 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 NCKAP1LP55160 1127 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 MTAPQ13126 283 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 GPR17Q13304 367 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 TEAD2Q15562 447 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 TAF12Q16514 161 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 ARSHQ5FYA8 562 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 VITQ6UXI7 678 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 METTL23Q86XA0 190 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 MAP4K3Q8IVH8 894 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 FAM212AQ96EL1 285 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 PGLYRP2Q96PD5 576 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 MSTO1Q9BUK6 570 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 CCSER1Q9C0I3 900 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 LMAN1LQ9HAT1 526 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 PARVGQ9HBI0 331 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 CEP72Q9P209 647 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 DSEQ9UL01 958 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 USP18Q9UMW8 372 aa15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 CHADO15335 359 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 LILRB5O75023 590 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 PLCG1P19174 1290 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 VIPR2P41587 438 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 CCR2P41597 374 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 CXCL12P48061 93 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 SPAG1Q07617 926 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 DUSP4Q13115 394 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 STK38Q15208 465 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 GPBP1Q86WP2 473 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 ZHX3Q9H4I2 956 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 DLL3Q9NYJ7 618 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 ZMYM5Q9UJ78 669 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 TBX20Q9UMR3 447 aa15.22■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 F5P12259 2224 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 A0A1W2PRU2 124 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 LACTBL1A8MY62 500 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 SPTLC2O15270 562 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 SMARCB1Q12824 385 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 MCM6Q14566 821 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 DGKKQ5KSL6 1271 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms