RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373184.5

PTPRT-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,483 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-202ENST00000373184 APPL1Q9UKG1 709 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 NDUFS3O75489 264 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 VCLP18206 1134 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PDCLQ13371 301 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SUFUQ9UMX1 484 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 BNIP3LO60238 219 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 F9P00740 461 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CETPP11597 493 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 UCHL3P15374 230 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SLC26A2P50443 739 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ADSSL1Q8N142 457 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 RAET1EQ8TD07 263 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 USP6NLQ92738 828 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ZFP42Q96MM3 310 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 KCNN4O15554 427 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 FCGR1AP12314 374 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PLA2G4AP47712 749 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 NME3Q13232 169 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PHKG1Q16816 387 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 AP4S1Q9Y587 144 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 DIP2BQ9P265 1576 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SEPT8Q92599 483 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 HBP1O60381 514 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PPP1R37O75864 691 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 IFNA14P01570 189 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 POLE2P56282 527 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PRKCQQ04759 706 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 RIN3Q8TB24 985 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PDP2Q9P2J9 529 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 C21orf2O43822 256 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ZW10O43264 779 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 RGS2P41220 211 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SERPINB8P50452 374 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 NAA20P61599 178 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 DMC1Q14565 340 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 VPS72Q15906 364 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SPATA18Q8TC71 538 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 EME1Q96AY2 570 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SOX13Q9UN79 622 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 APRTP07741 180 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 KCNK10P57789 538 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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