RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 RCOR1Q9UKL0 485 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CDH7Q9ULB5 785 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 UBE4BO95155 1302 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CACNA1HO95180 2353 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA8IPA6NC78 632 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 OR6C75A6NL08 312 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA8JA6NMD2 632 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ANHXE9PGG2 379 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PIRO00625 290 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SPTLC1O15269 473 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 NARSO43776 548 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 EXTL3O43909 919 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SEC24AO95486 1093 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
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SGMS1-201ENST00000361543 OR4Q2P0C623 313 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TAF6P49848 677 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 WNT7BP56706 349 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 NHLH1Q02575 133 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ADCY1Q08828 1119 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ELMOD1Q8N336 334 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ITFG1Q8TB96 612 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ING5Q8WYH8 240 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 FGF13Q92913 245 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 NXPE3Q969Y0 559 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SENP8Q96LD8 212 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF560Q96MR9 790 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PCIF1Q9H4Z3 704 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 USP25Q9UHP3 1055 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 KCNH3Q9ULD8 1083 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 MAFFQ9ULX9 164 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PTPRDP23468 1912 aa8.28□□□□□ -1.08
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SGMS1-201ENST00000361543 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 COL4A2P08572 1712 aa8.28□□□□□ -1.08
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SGMS1-201ENST00000361543 CYP11A1P05108 521 aa8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CFHP08603 1231 aa8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SRFP11831 508 aa8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CEBPBP17676 345 aa8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 PTPN2P17706 415 aa8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CASP1P29466 404 aa8.27□□□□□ -1.09
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SGMS1-201ENST00000361543 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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SGMS1-201ENST00000361543 SV2CQ496J9 727 aa8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 IER5LQ5T953 404 aa8.27□□□□□ -1.09
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SGMS1-201ENST00000361543 UNC13DQ70J99 1090 aa8.27□□□□□ -1.09
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SGMS1-201ENST00000361543 GPD1LQ8N335 351 aa8.27□□□□□ -1.09
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SGMS1-201ENST00000361543 FGF14Q92915 247 aa8.27□□□□□ -1.09
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SGMS1-201ENST00000361543 PRRX2Q99811 253 aa8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CORO1BQ9BR76 489 aa8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 DSEQ9UL01 958 aa8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 YIPF1Q9Y548 306 aa8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 COL4A3Q01955 1670 aa8.27□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GVL5 298 aa8.26□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PQ27 194 aa8.26□□□□□ -1.09
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