RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 RFWD2Q8NHY2 731 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SPIRE2Q8WWL2 714 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SMC6Q96SB8 1091 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ADAM33Q9BZ11 813 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 VAV3Q9UKW4 847 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 BCS1LQ9Y276 419 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SORBS3O60504 671 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ENTPD3O75355 529 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 GAS8O95995 478 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 FOSP01100 380 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 FAM163BP0C2L3 166 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 GCAP28676 217 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ERFP50548 548 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 CDK7P50613 346 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 INHBCP55103 352 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 BMT2Q1RMZ1 405 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 UTRNP46939 3433 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 A0A0G2JND7 137 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 AMPD1P23109 780 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 CETN2P41208 172 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 USP46P62068 366 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 CAV1Q03135 178 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 RINLQ6ZS11 566 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ZNF365Q70YC5 407 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TPH2Q8IWU9 490 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 WDR18Q9BV38 432 aa17.76■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 FSCN2O14926 492 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 DPY19L2Q6NUT2 758 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 MORC4Q8TE76 937 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ETNK2Q9NVF9 386 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TMOD2Q9NZR1 351 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TBX3O15119 743 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SETSIPP0DME0 302 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 NR1H3Q13133 447 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TCEAL1Q15170 157 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 NSMFQ6X4W1 530 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 NSL1Q96IY1 281 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 FAM20AQ96MK3 541 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 NUP85Q9BW27 656 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TAS2R1Q9NYW7 299 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 HEY2Q9UBP5 337 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17.75■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ATRNL1Q5VV63 1379 aa17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 MYL7Q01449 175 aa17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 DSG1Q02413 1049 aa17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 MAPK6Q16659 721 aa17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 LVRNQ6Q4G3 990 aa17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 HIC2Q96JB3 615 aa17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 WDR91A4D1P6 747 aa17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TBCAO75347 108 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 FAM200BP0CF97 657 aa17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 COG2Q14746 738 aa17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 PCDHB18PQ96TA0 734 aa17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 HERPUD2Q9BSE4 406 aa17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa17.74■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 MAGEA4P43358 317 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ZNF398Q8TD17 642 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 CCDC28BQ9BUN5 200 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 MTA2O94776 668 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 CIITAP33076 1130 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SLC18A1P54219 525 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 IZUMO3Q5VZ72 239 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 FAM118BQ9BPY3 351 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 RHBDL2Q9NX52 303 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 A6NJR5 290 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SPDYE6P0CI01 402 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SERPINB3P29508 390 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 NMT1P30419 496 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 PIK3CAP42336 1068 aa17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms