RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 DSEQ9UL01 958 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
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GIPC1-201ENST00000345425 MFAP3P55082 362 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 TAP1Q03518 808 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 RRAGAQ7L523 313 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 C17orf80Q9BSJ5 609 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 GANQ9H2C0 597 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 SLC28A3Q9HAS3 691 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHB8Q9UN66 801 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP29.76■■■□□ 2.35
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GIPC1-201ENST00000345425 C5orf67F2Z3F1 127 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 I3L4J1 428 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 SYN3O14994 580 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 FGF18O76093 207 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF15O94989 841 aa29.75■■■□□ 2.35
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GIPC1-201ENST00000345425 PLCB3Q01970 1234 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 LRIT3Q3SXY7 679 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 PPP2R2DQ66LE6 453 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM86AQ8N2M4 240 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 GPR62Q9BZJ7 368 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 NOL4O94818 638 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 FAM163BP0C2L3 166 aa29.75■■■□□ 2.35
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GIPC1-201ENST00000345425 SMYD3Q9H7B4 428 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC12Q9UKB3 198 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 L1RE1Q9UN81 338 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 TYMPP19971 482 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 FAM171A1Q5VUB5 890 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 GJB7Q6PEY0 223 aa29.74■■■□□ 2.35
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GIPC1-201ENST00000345425 LIMS2Q7Z4I7 341 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 METTL23Q86XA0 190 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 TTC39CQ8N584 583 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA18Q8TC71 538 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 FHOD1Q9Y613 1164 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 TACC1O75410 805 aa29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 EFEMP2O95967 443 aa29.73■■■□□ 2.35
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GIPC1-201ENST00000345425 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 PDCL2Q8N4E4 241 aa29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 TIFAQ96CG3 184 aa29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 CEP72Q9P209 647 aa29.73■■■□□ 2.35
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GIPC1-201ENST00000345425 USP41Q3LFD5 358 aa29.72■■■□□ 2.35
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GIPC1-201ENST00000345425 WSCD1Q658N2 575 aa29.72■■■□□ 2.35
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GIPC1-201ENST00000345425 KAT5Q92993 513 aa29.71■■■□□ 2.35
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GIPC1-201ENST00000345425 CISHQ9NSE2 258 aa29.7■■■□□ 2.35
GIPC1-201ENST00000345425 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
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GIPC1-201ENST00000345425 CD58P19256 250 aa29.69■■■□□ 2.34
GIPC1-201ENST00000345425 WARSP23381 471 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
GIPC1-201ENST00000345425 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
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