RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 DIAPH2O60879 1101 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 SPAG6O75602 509 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 RBP3P10745 1247 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 HERVK_113P62684 666 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 UBA3Q8TBC4 463 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA18Q8TC71 538 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 TMC2Q8TDI7 906 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 WNT10BO00744 389 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 OPTNQ96CV9 577 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP23Q9P227 1491 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 AGTP01019 485 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ATXN8OSP0DMR3 200 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDH1A3P47895 512 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CENPCQ03188 943 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 PKN1Q16512 942 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKMY2Q8IV38 441 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 EPC1Q9H2F5 836 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 AAASQ9NRG9 546 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CST8O60676 142 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 KPNA6O60684 536 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 KLK7P49862 253 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 FIGNQ5HY92 759 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ACAD10Q6JQN1 1059 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 KIRREL3Q8IZU9 778 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ARRDC4Q8NCT1 418 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM169Q96HH4 297 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CARD9Q9H257 536 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 DCTN4Q9UJW0 460 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINB9P50453 376 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 PHEXP78562 749 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 IL31Q6EBC2 164 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF135Q8IUD6 432 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 SH3KBP1Q96B97 665 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 NEU2Q9Y3R4 380 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXA2O43364 376 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 B3GAT3O94766 335 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 DDNO94850 711 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ANP32DO95626 131 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 SCFD1Q8WVM8 642 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 NCLNQ969V3 563 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM51Q9BSJ1 452 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 AIPL1Q9NZN9 384 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 STRNO43815 780 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO1DO94832 1006 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 GYS2P54840 703 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CDR2Q01850 454 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 TTI2Q6NXR4 508 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF720Q7Z2F6 126 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM10Q9UDY6 481 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 LMNAP02545 664 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC2A3P11169 496 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 PYGBP11216 843 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 NCAM1P13591 858 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 HARS2P49590 506 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 TBCCQ15814 346 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 JAMLQ86YT9 394 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 GPC2Q8N158 579 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPAN17Q96FV3 270 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 TRABDQ9H4I3 376 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 OLFML3Q9NRN5 406 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 KITP10721 976 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 PON1P27169 355 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 DDR1Q08345 913 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 E2F5Q15329 346 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 EPC2Q52LR7 807 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CENPPQ6IPU0 288 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CHSY1Q86X52 802 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 PBXIP1Q96AQ6 731 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CGRRF1Q99675 332 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CBWD1Q9BRT8 395 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 IL17RBQ9NRM6 502 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 PPLO60437 1756 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF217Q8TC41 542 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC22O60826 627 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 VDRP11473 427 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 TERF2Q15554 542 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 GJB7Q6PEY0 223 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB42Q8N4Z0 105 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 VIPAS39Q9H9C1 493 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT82Q9NSB4 513 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 DCDC2CA8MYV0 355 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 SPAG7O75391 227 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 HADHAP40939 763 aa17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms