RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 ITGB3P05106 788 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 CYTH1Q15438 398 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 ALDH1A3P47895 512 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GTH6 734 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 RHOBTB3O94955 611 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 MYL2P10916 166 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEA9P43362 315 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 NPEPPSP55786 919 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 OR2W6PQ8NHA6 318 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 PARP9Q8IXQ6 854 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 SH2D3CQ8N5H7 860 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 CETPP11597 493 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 PTK7Q13308 1070 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 HPDLQ96IR7 371 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 TBX3O15119 743 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 COMTP21964 271 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 HARS2P49590 506 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 STX3Q13277 289 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA18Q8TC71 538 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 DDX5P17844 614 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 CPT1AP50416 773 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 GPR63Q9BZJ6 419 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 AP3B1O00203 1094 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A27O95847 323 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 CHSY1Q86X52 802 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 UBE3AQ05086 875 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC36Q1X8D7 754 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 C11orf74Q86VG3 221 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 MYO1CO00159 1063 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 DTX3LQ8TDB6 740 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 SEMA3FQ13275 785 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 PRR23AA6NEV1 266 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 IFNEQ86WN2 208 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 THPOP40225 353 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 NOTUMQ6P988 496 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 IL1RL2Q9HB29 575 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 KCND2Q9NZV8 630 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 SOAT1P35610 550 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 INPP5AQ14642 412 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 USP49Q70CQ1 688 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 CAPN10Q9HC96 672 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 FAM71DQ8N9W8 422 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 SEPT8Q92599 483 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 AKAP10O43572 662 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 DDHD2O94830 711 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 VPS72Q15906 364 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 HBP1O60381 514 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 DGKIO75912 1065 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ITIH2P19823 946 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ACADSBP45954 432 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ANTXR2P58335 489 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 TRADDQ15628 312 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 BTN2A2Q8WVV5 523 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 NTSR2O95665 410 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CHRM3P20309 590 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 PCSK1P29120 753 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 NAB2Q15742 525 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 JCADQ9P266 1359 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 HDAC4P56524 1084 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SDE2Q6IQ49 451 aa23.38■■□□□ 1.33
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