RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 B4GALT3O60512 393 aa23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 CLCN1P35523 988 aa23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 OR1G1P47890 313 aa23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 C3orf58Q8NDZ4 430 aa23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.383e-6■■■□□ 16.1
CTU2-201ENST00000312060 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 CNTN6Q9UQ52 1028 aa23.68■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP6O43182 974 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 LRRC43Q8N309 656 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 HUS1O60921 280 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 SOWAHAQ2M3V2 549 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 SMYD5Q6GMV2 418 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 DPH6Q7L8W6 267 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 SENP8Q96LD8 212 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 CCDC42Q96M95 316 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 CYB561D2O14569 222 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 PAX3P23760 479 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 PTK2Q05397 1052 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 ZNF394Q53GI3 561 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 RAD9BQ6WBX8 426 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 DSTYKQ6XUX3 929 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 SLC47A2Q86VL8 602 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 TTC39CQ8N584 583 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 APPL2Q8NEU8 664 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 DEF6Q9H4E7 631 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 ALDH2P05091 517 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 BPIFB4P59827 614 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 MTF1Q14872 753 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 CD300LGQ6UXG3 332 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 CCDC170Q8IYT3 715 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 HASPINQ8TF76 798 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 ACP6Q9NPH0 428 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 HCSTQ9UBK5 93 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 COL4A6Q14031 1691 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 NRP1O14786 923 aa23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 CILPO75339 1184 aa23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 TACC1O75410 805 aa23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 KIF4AO95239 1232 aa23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 INCA1Q0VD86 236 aa23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 LIMS2Q7Z4I7 341 aa23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 HERVK_113Q902F9 699 aa23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 L1RE1Q9UN81 338 aa23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ITGB1P05556 798 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 CYP11B1P15538 503 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 BRCC3P46736 316 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 PDE6CP51160 858 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ZNF132P52740 706 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 EPS8L1Q8TE68 723 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 F8W810 466 aa23.63■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 NDST1P52848 882 aa23.63■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 VPS36Q86VN1 386 aa23.63■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 OR6B3Q8NGW1 331 aa23.63■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 WHAMMQ8TF30 809 aa23.63■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 YME1L1Q96TA2 773 aa23.63■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.63■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 AKR1B10O60218 316 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 TADA2AO75478 443 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 NDUFA10O95299 355 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 GALTP07902 379 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 FAM163BP0C2L3 166 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 GNA15P30679 374 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 SLC11A1P49279 550 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 AGPAT1Q99943 283 aa23.62■■□□□ 1.37
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