RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283206.8

TMEM87B-201, Transcript of transmembrane protein 87B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TMEM87B, Length 5,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87B-201ENST00000283206 RBBP7Q16576 425 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 LONRF1Q17RB8 773 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CCDC78A2IDD5 438 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 OGTO15294 1046 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 RAD51CO43502 376 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 HIST1H2ADP20671 130 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 OR1G1P47890 313 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 KCNB2Q92953 911 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SGSM3Q96HU1 749 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ITGB3P05106 788 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MUTP22033 750 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SREBF1P36956 1147 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 USP38Q8NB14 1042 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 STKLD1Q8NE28 680 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ERP44Q9BS26 406 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MED24O75448 989 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 NDUFS3O75489 264 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 KCNJ1P48048 391 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SERPINB4P48594 390 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 GJB7Q6PEY0 223 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MTBPQ96DY7 904 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SYCE1LA8MT33 242 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM200BP0CF97 657 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 KRT4P19013 534 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 FGFR2P21802 821 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 BOLA3Q53S33 107 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MFN1Q8IWA4 741 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 TEX12Q9BXU0 123 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CARD9Q9H257 536 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MTSS1O43312 755 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MCF2P10911 925 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 BACE1P56817 501 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ANO5Q75V66 913 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 NAGPAQ9UK23 515 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CYP2C8P10632 490 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CENPCQ03188 943 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 STX3Q13277 289 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CUL2Q13617 745 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CUL3Q13618 768 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 KYNUQ16719 465 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 HMOX2P30519 316 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 ARL8AQ96BM9 186 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 GMCL1Q96IK5 515 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 EHD4Q9H223 541 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 RSPH10BP0C881 870 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 MAGEA4P43358 317 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 CEP19Q96LK0 163 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 TSC22D3Q99576 134 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms