RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ACOT2P49753 483 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ROR1Q01973 937 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MYO1EQ12965 1108 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 KCTD2Q14681 263 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CNGA2Q16280 664 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 COG5Q9UP83 839 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 HGSO14964 777 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PRKCBP05771 671 aa9.33□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 PHKA2P46019 1235 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 STAT5BP51692 787 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SLCO2A1Q92959 643 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 WRNIP1Q96S55 665 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PI4K2AQ9BTU6 479 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SHBGP04278 402 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ITGB5P18084 799 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 FLT3P36888 993 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SCYL2Q6P3W7 929 aa9.33□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 FAF2Q96CS3 445 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 BTAF1O14981 1849 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 KRT38O76015 456 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ADCY1Q08828 1119 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TFDP3Q5H9I0 405 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TMEM143Q96AN5 459 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ATG4CQ96DT6 458 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MCEEQ96PE7 176 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.33□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.33□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 H0YGN5 161 aa9.32□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TSHRP16473 764 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 OSBPP22059 807 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 FUKQ8N0W3 1084 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 DNERQ8NFT8 737 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 APBB2Q92870 758 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 C9orf72Q96LT7 481 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PCDHB18PQ96TA0 734 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 RSAD1Q9HA92 442 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.32□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 HAUS5O94927 633 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZBED1O96006 694 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TAF11Q15544 211 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 BACE1P56817 501 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GADL1Q6ZQY3 521 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 VWA5AO00534 786 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 LPXNO60711 386 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SPAG7O75391 227 aa9.32□□□□□ -0.92
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