RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 DLG4P78352 724 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 MTA1Q13330 715 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 ATP9BO43861 1147 aa22.4■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 CIB2O75838 187 aa22.4■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 RALAP11233 206 aa22.4■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 MED21Q13503 144 aa22.4■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 RASA2Q15283 850 aa22.4■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 RFX1P22670 979 aa22.4■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.182e-8■■■■■ 31.4
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ODC1-201ENST00000234111 SFT2D3Q587I9 215 aa22.4■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 C1orf146Q5VVC0 180 aa22.4■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 ERMNQ8TAM6 284 aa22.4■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.4■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 SLC26A4O43511 780 aa22.39■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 BANF1O75531 89 aa22.38■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 RGS2P41220 211 aa22.38■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 CENPCQ03188 943 aa22.38■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 EML1O00423 815 aa22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 TM7SF2O76062 418 aa22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 KDSRQ06136 332 aa22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 DLG1Q12959 904 aa22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 LPCAT4Q643R3 524 aa22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 NFIL3Q16649 462 aa22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 HAUS1Q96CS2 278 aa22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 MTBPQ96DY7 904 aa22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 DMAC2Q9NW81 257 aa22.37■■□□□ 1.17
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