RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000226524.3

PF4V1-201, Transcript of platelet factor 4 variant 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PF4V1, Length 522 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1-201ENST00000226524 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 FEZF2Q8TBJ5 459 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 SPATA18Q8TC71 538 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 IRF7Q92985 503 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 MSANTD3Q96H12 275 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 SENP8Q96LD8 212 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 CLIC6Q96NY7 704 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 GCNAQ96QF7 691 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 PIEZO1Q92508 2521 aa11.64□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 ANO9A1A5B4 782 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 KRBA1A5PL33 1030 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 MYMKA6NI61 221 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 PPP1R37O75864 691 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 MYL4P12829 197 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 EPHA5P54756 1037 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 TSPY1Q01534 308 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 PPP2R5DQ14738 602 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 ANGPT1Q15389 498 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 PRSS36Q5K4E3 855 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 SLC39A4Q6P5W5 647 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 USP49Q70CQ1 688 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 YAF2Q8IY57 180 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 PJA1Q8NG27 643 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 ING5Q8WYH8 240 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 SMARCD2Q92925 531 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 IER2Q9BTL4 223 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 STRA6Q9BX79 667 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 BRD9Q9H8M2 597 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 TRPV5Q9NQA5 729 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 YIPF1Q9Y548 306 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.63□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 KPNA7A9QM74 516 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 CYB561D2O14569 222 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 EXTL3O43909 919 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 HUS1O60921 280 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 SEC24AO95486 1093 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 NFICP08651 508 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 GLULP15104 373 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 PSMC3P17980 439 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 MYO1EQ12965 1108 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 DUSP4Q13115 394 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 CENPPQ6IPU0 288 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 FAM173BQ6P4H8 233 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 BRSK2Q8IWQ3 736 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 GPD1LQ8N335 351 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 PDILTQ8N807 584 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 LRRC15Q8TF66 581 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 KXD1Q9BQD3 176 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 UBE4BO95155 1302 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 ZNF233A6NK53 670 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 SOBPA7XYQ1 873 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 DPYSL4O14531 572 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 ZNF263O14978 683 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 PI15O43692 258 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 CEBPBP17676 345 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 CDC25CP30307 473 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 RBP5P82980 135 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 MYL7Q01449 175 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 SLC5A9Q2M3M2 681 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 C1orf210Q8IVY1 113 aa11.61□□□□□ -0.55
PF4V1-201ENST00000226524 PSMG2Q969U7 264 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms